37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0903 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0903  peptidase C1A, papain  100 
 
 		 496 aa  1023    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0222  peptidase C1A, papain  81.85 
 
 		 497 aa  860    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107237  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1038  hypothetical protein  37.63 
 
 		 475 aa  299  8e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  40.04 
 
 		 725 aa  298  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  35.83 
 
 		 1236 aa  277  4e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  37.29 
 
 		 1092 aa  250  3e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0559  peptidase C1A papain  36.11 
 
 		 2353 aa  248  1e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.735343  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0305  preprotein translocase subunit SecD-like protein  28.04 
 
 		 571 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.303617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  30.25 
 
 		 812 aa  91.3  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  30.08 
 
 		 1202 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  26.05 
 
 		 619 aa  80.1  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  27.9 
 
 		 1096 aa  73.2  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26082  predicted protein  27.59 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0135575 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25433  predicted protein  28.51 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  27.98 
 
 		 1066 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50321  predicted protein  28.45 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  28.82 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  26.3 
 
 		 820 aa  57.4  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1318  peptidase C1A, papain  26.55 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0624769  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  26.72 
 
 		 305 aa  53.5  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  38.24 
 
 		 535 aa  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_4995  predicted protein  26.55 
 
 		 241 aa  52  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  22.64 
 
 		 1332 aa  51.2  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0109  peptidase C1A papain  25 
 
 		 308 aa  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13119  predicted protein  24.19 
 
 		 241 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.128746  normal  0.100264 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  43.14 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  48.08 
 
 		 303 aa  48.5  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16088  predicted protein  24.69 
 
 		 478 aa  47.8  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00877055 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0130  peptidase C1A papain  40.38 
 
 		 307 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  38.89 
 
 		 487 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  26.91 
 
 		 789 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1673  peptidase C1A, papain  24.49 
 
 		 368 aa  45.8  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00360531  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2509  hypothetical protein  25.66 
 
 		 364 aa  44.7  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  25.93 
 
 		 494 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  41.51 
 
 		 307 aa  43.9  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4065  peptidase C1A, papain  41.3 
 
 		 224 aa  43.5  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.561338 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  24.83 
 
 		 814 aa  43.5  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.590308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>