56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5291 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  100 
 
 
354 aa  729    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  36.49 
 
 
1202 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  35.39 
 
 
812 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  34.07 
 
 
1096 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  30.45 
 
 
1066 aa  95.9  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  32.74 
 
 
619 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26082  predicted protein  28.1 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0135575 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  27.34 
 
 
1236 aa  80.5  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1673  peptidase C1A, papain  26.67 
 
 
368 aa  80.1  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00360531  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1038  hypothetical protein  27.47 
 
 
475 aa  79.7  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43432  predicted protein  29.61 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00267457  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_4741  predicted protein  31.49 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_4936  predicted protein  27.85 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50321  predicted protein  27.45 
 
 
424 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25433  predicted protein  26.67 
 
 
360 aa  70.9  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9664  predicted protein  27.16 
 
 
259 aa  68.9  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.345289  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0903  peptidase C1A, papain  28.82 
 
 
496 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0559  peptidase C1A papain  29.46 
 
 
2353 aa  66.6  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.735343  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0222  peptidase C1A, papain  29 
 
 
497 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107237  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94479  predicted protein  29.29 
 
 
330 aa  64.3  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0456451 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45795  predicted protein  24.03 
 
 
666 aa  63.5  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189195  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39605  predicted protein  26.21 
 
 
316 aa  63.2  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.673199  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  25.55 
 
 
820 aa  63.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  25.73 
 
 
725 aa  62.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13119  predicted protein  27.69 
 
 
241 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.128746  normal  0.100264 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16088  predicted protein  28.3 
 
 
478 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00877055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  35.29 
 
 
789 aa  59.3  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0109  peptidase C1A papain  25.55 
 
 
308 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  55.56 
 
 
814 aa  56.2  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7559  predicted protein  27.72 
 
 
227 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  31.19 
 
 
487 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  25.2 
 
 
1092 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0305  preprotein translocase subunit SecD-like protein  25.87 
 
 
571 aa  55.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.303617  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  31.62 
 
 
303 aa  54.3  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  36.99 
 
 
271 aa  52.8  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  26.11 
 
 
305 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  36.99 
 
 
271 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0734  cysteine protease  24.51 
 
 
323 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2646  peptidase C1A papain  45.65 
 
 
268 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_4995  predicted protein  28.04 
 
 
241 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0130  peptidase C1A papain  24.07 
 
 
307 aa  50.4  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  35.71 
 
 
272 aa  50.4  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1318  peptidase C1A, papain  22.52 
 
 
492 aa  49.7  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0624769  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16085  predicted protein  24.24 
 
 
550 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.659128  hitchhiker  0.00285712 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20066  predicted protein  23.93 
 
 
347 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4065  peptidase C1A, papain  34.15 
 
 
224 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.561338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  38.3 
 
 
255 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  38.3 
 
 
255 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  27.97 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  37.93 
 
 
307 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  42.59 
 
 
535 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4188  peptidase C1A papain  33.93 
 
 
599 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  28.89 
 
 
1242 aa  44.7  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  33.77 
 
 
284 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  46.81 
 
 
1332 aa  43.5  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  43.9 
 
 
494 aa  42.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>