20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2509 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2509  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  754    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2639  hypothetical protein  97.8 
 
 
364 aa  710    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2547  hypothetical protein  44.08 
 
 
353 aa  248  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2675  hypothetical protein  44.08 
 
 
353 aa  247  3e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  27.11 
 
 
395 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  25 
 
 
814 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  25.86 
 
 
272 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  47.17 
 
 
870 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  24.58 
 
 
305 aa  50.1  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1038  hypothetical protein  25.51 
 
 
475 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0130  peptidase C1A papain  22.38 
 
 
307 aa  46.6  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  21.65 
 
 
934 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  22.78 
 
 
271 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2646  peptidase C1A papain  25.1 
 
 
268 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  22.78 
 
 
271 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  25.68 
 
 
697 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  41.27 
 
 
1092 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  36 
 
 
307 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0903  peptidase C1A, papain  26.42 
 
 
496 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  30.65 
 
 
535 aa  43.1  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>