40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0130 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0130  peptidase C1A papain  100 
 
 
307 aa  634    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0109  peptidase C1A papain  69.16 
 
 
308 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  62.87 
 
 
307 aa  424  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  61.44 
 
 
303 aa  404  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0734  cysteine protease  61.59 
 
 
323 aa  394  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  54.67 
 
 
305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  40.08 
 
 
395 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  32.52 
 
 
272 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  31.07 
 
 
255 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  30.71 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  31.99 
 
 
271 aa  117  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  31.65 
 
 
271 aa  115  8.999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2646  peptidase C1A papain  31.74 
 
 
268 aa  102  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1250  peptidase C1A papain  28.46 
 
 
477 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0216738  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  27.8 
 
 
934 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  28.03 
 
 
284 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04730  cysteine protease  25.73 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0404654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04739  cysteine protease  23.95 
 
 
270 aa  60.8  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  27.12 
 
 
820 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4065  peptidase C1A, papain  27.31 
 
 
224 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.561338 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  26.83 
 
 
789 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  25.6 
 
 
1236 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  28.94 
 
 
812 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  25.93 
 
 
487 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  21.61 
 
 
725 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3607  peptidase C1A papain  23.6 
 
 
270 aa  50.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  26.16 
 
 
1066 aa  49.3  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1038  hypothetical protein  41.67 
 
 
475 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0222  peptidase C1A, papain  40.38 
 
 
497 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107237  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  24.09 
 
 
354 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  25.51 
 
 
1202 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2509  hypothetical protein  22.38 
 
 
364 aa  46.6  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0903  peptidase C1A, papain  40.38 
 
 
496 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  37.14 
 
 
814 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2639  hypothetical protein  38 
 
 
364 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0305  preprotein translocase subunit SecD-like protein  25.84 
 
 
571 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.303617  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25433  predicted protein  21.46 
 
 
360 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2547  hypothetical protein  41.18 
 
 
353 aa  43.1  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2675  hypothetical protein  41.18 
 
 
353 aa  43.1  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  26.09 
 
 
494 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>