21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3607 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3607  peptidase C1A papain  100 
 
 
270 aa  551  1e-156  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  26.03 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  26.03 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2646  peptidase C1A papain  26.58 
 
 
268 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  26.51 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  26.34 
 
 
255 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  26.52 
 
 
305 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0130  peptidase C1A papain  23.6 
 
 
307 aa  50.4  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  27.08 
 
 
255 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  27.55 
 
 
934 aa  49.3  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  25.1 
 
 
307 aa  49.3  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0109  peptidase C1A papain  24 
 
 
308 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  23.96 
 
 
395 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1306  peptidase C1A, papain  25.82 
 
 
688 aa  46.2  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0209237  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3867  peptidase C1A papain  24.23 
 
 
640 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2675  hypothetical protein  26.07 
 
 
688 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  26.11 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3580  hypothetical protein  25.23 
 
 
753 aa  43.5  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.28463  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2994  peptidase C1A papain  24.03 
 
 
405 aa  42.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.766742  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03990  peptidase C1A, papain  27.18 
 
 
592 aa  42.7  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1250  peptidase C1A papain  25.53 
 
 
477 aa  42.7  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0216738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>