130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2451 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  100 
 
 		 1202 aa  2404    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  65.74 
 
 		 812 aa  1030    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0739  Cna B domain-containing protein  38.37 
 
 		 536 aa  229  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000604676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4546  Cna B domain-containing protein  54.87 
 
 		 690 aa  203  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  35.76 
 
 		 1096 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  35.07 
 
 		 354 aa  113  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3936  Cna B domain-containing protein  47.9 
 
 		 330 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0567855  normal  0.0675553 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  35.4 
 
 		 1066 aa  101  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25433  predicted protein  30.8 
 
 		 360 aa  99.8  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  29.03 
 
 		 619 aa  99  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50321  predicted protein  33.33 
 
 		 424 aa  98.2  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1038  hypothetical protein  30.61 
 
 		 475 aa  90.1  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  28.77 
 
 		 3373 aa  89.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13119  predicted protein  31.07 
 
 		 241 aa  89.4  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.128746  normal  0.100264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0222  peptidase C1A, papain  30.47 
 
 		 497 aa  89  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107237  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0903  peptidase C1A, papain  30.08 
 
 		 496 aa  89  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  31.79 
 
 		 725 aa  88.6  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0559  peptidase C1A papain  33.05 
 
 		 2353 aa  87.8  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.735343  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  28.57 
 
 		 1236 aa  86.3  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  31.6 
 
 		 1578 aa  85.1  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0097  Cna B domain-containing protein  60.27 
 
 		 135 aa  85.1  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26082  predicted protein  29.86 
 
 		 272 aa  83.2  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0135575 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4110  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.69 
 
 		 753 aa  77.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.61298 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1673  peptidase C1A, papain  27.63 
 
 		 368 aa  73.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00360531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  24.5 
 
 		 814 aa  72.4  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36150  putative collagen-binding protein  30.34 
 
 		 727 aa  71.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2670  hypothetical protein  29.51 
 
 		 680 aa  68.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.750364 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20066  predicted protein  29.39 
 
 		 347 aa  68.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.46 
 
 		 2182 aa  67.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1596  hypothetical protein  29.34 
 
 		 693 aa  67  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000327656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  25.74 
 
 		 2933 aa  65.1  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0460  FG-GAP repeat-containing protein  33.59 
 
 		 2474 aa  64.3  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  29.3 
 
 		 1628 aa  63.9  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  29.72 
 
 		 535 aa  63.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45795  predicted protein  26.19 
 
 		 666 aa  63.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189195  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16088  predicted protein  26.81 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00877055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  25.19 
 
 		 2047 aa  61.6  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3511  hypothetical protein  25.38 
 
 		 926 aa  61.6  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.45252 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3054  hypothetical protein  27.47 
 
 		 681 aa  60.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000100223  hitchhiker  0.00791247 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_4741  predicted protein  28.1 
 
 		 237 aa  61.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  27.54 
 
 		 1092 aa  60.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16085  predicted protein  23.36 
 
 		 550 aa  60.1  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.659128  hitchhiker  0.00285712 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2620  Cna B domain protein  42.7 
 
 		 456 aa  60.1  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208215  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3311  PDZ/DHR/GLGF domain protein  22.92 
 
 		 742 aa  59.7  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4418  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.85 
 
 		 2171 aa  59.7  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  26.94 
 
 		 1332 aa  58.9  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0305  preprotein translocase subunit SecD-like protein  26.12 
 
 		 571 aa  58.5  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.303617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_4995  predicted protein  27.4 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  30.09 
 
 		 1242 aa  58.5  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  29.39 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  20.78 
 
 		 3333 aa  58.2  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1022  hypothetical protein  30.12 
 
 		 804 aa  58.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  27.23 
 
 		 789 aa  57  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2471  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.85 
 
 		 1489 aa  57  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43432  predicted protein  27.2 
 
 		 353 aa  57  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00267457  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  28.5 
 
 		 820 aa  57  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3913  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.77 
 
 		 1710 aa  56.2  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  20.66 
 
 		 3486 aa  55.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  31.06 
 
 		 134 aa  55.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9664  predicted protein  30.04 
 
 		 259 aa  55.8  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.345289  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0109  peptidase C1A papain  26.69 
 
 		 308 aa  55.5  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0627  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.46 
 
 		 1501 aa  55.5  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.84 
 
 		 1919 aa  54.7  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  27.51 
 
 		 305 aa  54.7  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  32.77 
 
 		 494 aa  54.7  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  20.44 
 
 		 3393 aa  54.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39605  predicted protein  27.24 
 
 		 316 aa  54.7  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.673199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1192  hypothetical protein  27.72 
 
 		 679 aa  54.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000450505  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  20.72 
 
 		 3242 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3164  Cna B-type  30.38 
 
 		 980 aa  53.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592408  normal  0.0320112 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  24.63 
 
 		 307 aa  53.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7559  predicted protein  26.72 
 
 		 227 aa  53.5  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94479  predicted protein  30.05 
 
 		 330 aa  53.5  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0456451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  28.57 
 
 		 133 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5207  collagen adhesion protein, C-terminal  22.12 
 
 		 882 aa  53.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_5520  predicted protein  27.43 
 
 		 245 aa  53.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.153526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  30.53 
 
 		 1514 aa  53.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1508  adhesion exoprotein  24.25 
 
 		 771 aa  52.8  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  24.38 
 
 		 2656 aa  52.8  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  38.04 
 
 		 1407 aa  52.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13870  hypothetical protein  34 
 
 		 132 aa  52.4  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.44 
 
 		 1085 aa  52  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  22.37 
 
 		 3392 aa  52.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04230  Cna B domain protein  33.73 
 
 		 609 aa  51.6  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  38.24 
 
 		 487 aa  51.6  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0734  cysteine protease  27.9 
 
 		 323 aa  51.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0078  hypothetical protein  31.82 
 
 		 129 aa  50.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.984341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3178  S-layer domain-containing protein  32.97 
 
 		 1518 aa  50.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  unclonable  0.0033347  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10538  hypothetical protein  48.84 
 
 		 370 aa  50.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0398  hypothetical protein  28.3 
 
 		 773 aa  50.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  26.96 
 
 		 284 aa  50.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  36.14 
 
 		 130 aa  50.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1442  hypothetical protein  34.13 
 
 		 190 aa  49.3  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_4936  predicted protein  26.09 
 
 		 256 aa  48.9  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3342  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.61 
 
 		 966 aa  48.9  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  25.36 
 
 		 1337 aa  48.5  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4279  secreted protein-like protein  33.33 
 
 		 130 aa  48.5  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  25.36 
 
 		 1337 aa  48.5  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6354  hypothetical protein  25.2 
 
 		 670 aa  48.5  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2927  hypothetical protein  49.25 
 
 		 649 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.956514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>