39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_13870 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_13870  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  270  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  56.8 
 
 
133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4363  putative lipoprotein  56.45 
 
 
130 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144177  normal  0.0276166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3945  hypothetical protein  50 
 
 
130 aa  137  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4279  secreted protein-like protein  53.6 
 
 
130 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1442  hypothetical protein  53.6 
 
 
190 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  56.35 
 
 
134 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4211  lipoprotein, putative  47.62 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1079  putative lipoprotein  56.52 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  51.85 
 
 
130 aa  123  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4580  hypothetical protein  51.4 
 
 
130 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0706  hypothetical protein  31.13 
 
 
201 aa  60.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1679  hypothetical protein  28.7 
 
 
140 aa  58.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.213144 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1262  secreted protein-like protein  31.07 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1893  hypothetical protein  26.85 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.479923  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1927  hypothetical protein  29.63 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000111149  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2681  secreted protein-like  30.91 
 
 
412 aa  56.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.593103  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  30.63 
 
 
215 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  33.77 
 
 
746 aa  53.9  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0916  hypothetical protein  27.18 
 
 
288 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.964057  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  30.77 
 
 
745 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  29.73 
 
 
745 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0066  hypothetical protein  31.58 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0701675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  34 
 
 
1202 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2068  hypothetical protein  31.03 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  27.93 
 
 
316 aa  51.6  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1239  lipoprotein  25.24 
 
 
127 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.619168  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4035  hypothetical protein  29.2 
 
 
176 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1461  putative lipoprotein  27.18 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.093492  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2202  secreted protein-like protein  28.57 
 
 
136 aa  50.4  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  32 
 
 
741 aa  48.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0675  hypothetical protein  29.76 
 
 
246 aa  47  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.994925  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  34.09 
 
 
812 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1242  hypothetical protein  26.67 
 
 
123 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0078  hypothetical protein  28.83 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.984341  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1242  hypothetical protein  25.56 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5290  Proteinase inhibitor I42, chagasin  28.57 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.440506 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2108  secreted protein-like protein  27.17 
 
 
183 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0929  hypothetical protein  26.36 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0056852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>