42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4741 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  100 
 
 
133 aa  269  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  93.28 
 
 
134 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3945  hypothetical protein  52.67 
 
 
130 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4279  secreted protein-like protein  57.14 
 
 
130 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4211  lipoprotein, putative  51.94 
 
 
130 aa  147  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1442  hypothetical protein  56.35 
 
 
190 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13870  hypothetical protein  56.8 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4363  putative lipoprotein  51.97 
 
 
130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144177  normal  0.0276166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  55.86 
 
 
130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1079  putative lipoprotein  52.63 
 
 
130 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4580  hypothetical protein  53.97 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1262  secreted protein-like protein  33.86 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0916  hypothetical protein  33.64 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.964057  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1461  putative lipoprotein  33.07 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.093492  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1679  hypothetical protein  26.67 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.213144 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1239  lipoprotein  30.08 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.619168  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0706  hypothetical protein  33.04 
 
 
201 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0066  hypothetical protein  31.31 
 
 
166 aa  61.6  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0701675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  33.04 
 
 
215 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4035  hypothetical protein  35.42 
 
 
176 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2202  secreted protein-like protein  28.7 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2068  hypothetical protein  31.68 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  33.33 
 
 
745 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1893  hypothetical protein  28.97 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.479923  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0929  hypothetical protein  34.92 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0056852 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1409  secreted protein  28.71 
 
 
269 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.894228  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  30.53 
 
 
746 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2681  secreted protein-like  35 
 
 
412 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.593103  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  28.57 
 
 
1202 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2108  secreted protein-like protein  26.55 
 
 
183 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1927  hypothetical protein  26.72 
 
 
152 aa  52.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000111149  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  28.71 
 
 
812 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  31.08 
 
 
745 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  30.23 
 
 
316 aa  50.8  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5290  Proteinase inhibitor I42, chagasin  32.98 
 
 
117 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.440506 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2055  hypothetical protein  25.96 
 
 
175 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.465998 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0675  hypothetical protein  31.58 
 
 
246 aa  48.5  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.994925  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  32.05 
 
 
741 aa  48.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2464  hypothetical protein  29.36 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0711042  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0078  hypothetical protein  36.49 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.984341  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4152  hypothetical protein  26.26 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337445  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1242  hypothetical protein  29.33 
 
 
123 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>