24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_4936 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_4936  predicted protein  100 
 
 
256 aa  533  1e-150  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_4741  predicted protein  64.73 
 
 
237 aa  317  1e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43432  predicted protein  58.56 
 
 
353 aa  317  2e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00267457  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39605  predicted protein  60.47 
 
 
316 aa  308  4e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.673199  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9664  predicted protein  57.79 
 
 
259 aa  305  4.0000000000000004e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.345289  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  31.33 
 
 
1096 aa  96.7  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50321  predicted protein  29.73 
 
 
424 aa  82.4  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16088  predicted protein  28.4 
 
 
478 aa  76.3  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00877055 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25433  predicted protein  28.46 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45795  predicted protein  27.43 
 
 
666 aa  72.4  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189195  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_5520  predicted protein  27.87 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.153526 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  27.57 
 
 
619 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  37.11 
 
 
354 aa  59.3  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26082  predicted protein  25 
 
 
272 aa  57  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0135575 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_4995  predicted protein  23.81 
 
 
241 aa  55.5  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  27.8 
 
 
812 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20066  predicted protein  24.5 
 
 
347 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16085  predicted protein  22.81 
 
 
550 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.659128  hitchhiker  0.00285712 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94479  predicted protein  28.32 
 
 
330 aa  50.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0456451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  26.09 
 
 
1202 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13119  predicted protein  23.72 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.128746  normal  0.100264 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7559  predicted protein  30.56 
 
 
227 aa  47  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1673  peptidase C1A, papain  21.72 
 
 
368 aa  46.6  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00360531  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  30.34 
 
 
1066 aa  46.2  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>