34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1442 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1442  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4279  secreted protein-like protein  96.15 
 
 
130 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4363  putative lipoprotein  77.52 
 
 
130 aa  208  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144177  normal  0.0276166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1079  putative lipoprotein  83.85 
 
 
130 aa  207  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3945  hypothetical protein  60.47 
 
 
130 aa  164  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4211  lipoprotein, putative  60.32 
 
 
130 aa  160  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4580  hypothetical protein  64.62 
 
 
130 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  56.35 
 
 
133 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  61.68 
 
 
130 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  54.33 
 
 
134 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13870  hypothetical protein  53.6 
 
 
132 aa  134  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2068  hypothetical protein  32.54 
 
 
164 aa  61.6  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2202  secreted protein-like protein  32.63 
 
 
136 aa  54.3  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  34.74 
 
 
215 aa  53.9  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  32.05 
 
 
745 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1679  hypothetical protein  26.05 
 
 
140 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.213144 
 
 
-
 
NC_002936  DET1461  putative lipoprotein  31.71 
 
 
127 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.093492  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1927  hypothetical protein  26.72 
 
 
152 aa  52.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000111149  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0929  hypothetical protein  29.6 
 
 
137 aa  52.4  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0056852 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  31.03 
 
 
745 aa  52  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0706  hypothetical protein  32.61 
 
 
201 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2681  secreted protein-like  29.17 
 
 
412 aa  51.2  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.593103  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  28.74 
 
 
746 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1262  secreted protein-like protein  28.69 
 
 
127 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  34.13 
 
 
1202 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0066  hypothetical protein  31.18 
 
 
166 aa  49.7  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0701675 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1239  lipoprotein  26.27 
 
 
127 aa  48.9  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.619168  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  30.77 
 
 
741 aa  47.4  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0916  hypothetical protein  25.89 
 
 
288 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.964057  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5290  Proteinase inhibitor I42, chagasin  29.59 
 
 
117 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.440506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4035  hypothetical protein  33.72 
 
 
176 aa  44.7  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0078  hypothetical protein  35.21 
 
 
129 aa  43.9  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.984341  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0675  hypothetical protein  31.33 
 
 
246 aa  42.4  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.994925  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2464  hypothetical protein  31.43 
 
 
139 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0711042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>