21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0305 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0305  preprotein translocase subunit SecD-like protein  100 
 
 		 571 aa  1158    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.303617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  26.77 
 
 		 725 aa  151  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  29.71 
 
 		 1236 aa  144  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1038  hypothetical protein  27.59 
 
 		 475 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  28.14 
 
 		 1092 aa  130  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0903  peptidase C1A, papain  28.29 
 
 		 496 aa  113  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0222  peptidase C1A, papain  27.39 
 
 		 497 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107237  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0559  peptidase C1A papain  26.32 
 
 		 2353 aa  95.1  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.735343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  25.97 
 
 		 1066 aa  64.3  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  26.12 
 
 		 1202 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  26.55 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf582  hypothetical lipoprotein, cysteine protease  22.46 
 
 		 789 aa  54.3  0.000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.118517  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  24.81 
 
 		 812 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  25.72 
 
 		 814 aa  47.4  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  26.32 
 
 		 303 aa  47  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  38.71 
 
 		 271 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  39.62 
 
 		 271 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0734  cysteine protease  28.04 
 
 		 323 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1318  peptidase C1A, papain  22.57 
 
 		 492 aa  45.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0624769  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0130  peptidase C1A papain  25.84 
 
 		 307 aa  44.7  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  35.19 
 
 		 272 aa  44.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>