50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1673 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1673  peptidase C1A, papain  100 
 
 		 368 aa  763    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00360531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  40.34 
 
 		 619 aa  133  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  34.18 
 
 		 1066 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  30.92 
 
 		 1096 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50321  predicted protein  31.58 
 
 		 424 aa  92.8  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  32.59 
 
 		 812 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  28.02 
 
 		 1202 aa  82.8  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  26.37 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39605  predicted protein  27.17 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.673199  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9664  predicted protein  26.74 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.345289  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43432  predicted protein  28.35 
 
 		 353 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00267457  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1672  hypothetical protein  49.32 
 
 		 117 aa  70.9  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00111256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1674  hypothetical protein  47.95 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.043525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_4995  predicted protein  30.94 
 
 		 241 aa  69.3  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25433  predicted protein  27.71 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26082  predicted protein  27.63 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0135575 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_4741  predicted protein  27.43 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  28.32 
 
 		 535 aa  66.6  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0559  peptidase C1A papain  25.61 
 
 		 2353 aa  64.3  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.735343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  26.34 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_4936  predicted protein  26.64 
 
 		 256 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13119  predicted protein  27.14 
 
 		 241 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.128746  normal  0.100264 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1038  hypothetical protein  25.58 
 
 		 475 aa  60.5  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  26.5 
 
 		 255 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  27.14 
 
 		 284 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  24.73 
 
 		 725 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45795  predicted protein  40 
 
 		 666 aa  53.9  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189195  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  23.11 
 
 		 1236 aa  53.5  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  23.89 
 
 		 1092 aa  53.5  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  25.89 
 
 		 789 aa  53.1  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  26.05 
 
 		 487 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0222  peptidase C1A, papain  25.32 
 
 		 497 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107237  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  26.01 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_5520  predicted protein  24.67 
 
 		 245 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.153526 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  27.17 
 
 		 494 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  26.01 
 
 		 271 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  22.14 
 
 		 820 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  25.08 
 
 		 303 aa  50.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  27.27 
 
 		 1242 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  22.61 
 
 		 305 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0903  peptidase C1A, papain  26.27 
 
 		 496 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  24.23 
 
 		 934 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2646  peptidase C1A papain  26.44 
 
 		 268 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0734  cysteine protease  23.97 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20066  predicted protein  27.07 
 
 		 347 aa  47  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94479  predicted protein  24.43 
 
 		 330 aa  46.6  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0456451 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  24.12 
 
 		 1628 aa  46.6  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  44.74 
 
 		 814 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0109  peptidase C1A papain  23.26 
 
 		 308 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  24.33 
 
 		 307 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>