48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4005 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  100 
 
 		 619 aa  1258    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  33.77 
 
 		 1096 aa  131  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1673  peptidase C1A, papain  39.91 
 
 		 368 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00360531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  29.03 
 
 		 1202 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  29.49 
 
 		 812 aa  99.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50321  predicted protein  29.6 
 
 		 424 aa  94.7  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  30.86 
 
 		 1066 aa  89  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_4995  predicted protein  31.49 
 
 		 241 aa  88.2  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26082  predicted protein  28.67 
 
 		 272 aa  86.7  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0135575 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  32.35 
 
 		 535 aa  81.6  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25433  predicted protein  28.81 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0903  peptidase C1A, papain  30.87 
 
 		 496 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13119  predicted protein  28.57 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.128746  normal  0.100264 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43432  predicted protein  26.46 
 
 		 353 aa  69.3  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00267457  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45795  predicted protein  28.45 
 
 		 666 aa  67  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189195  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0222  peptidase C1A, papain  28.96 
 
 		 497 aa  65.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107237  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  31.58 
 
 		 725 aa  64.3  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  32.74 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_4741  predicted protein  28.44 
 
 		 237 aa  62  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_4936  predicted protein  27.57 
 
 		 256 aa  62  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39605  predicted protein  28.57 
 
 		 316 aa  60.1  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.673199  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_5520  predicted protein  27.43 
 
 		 245 aa  60.1  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.153526 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.03 
 
 		 1085 aa  58.9  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7559  predicted protein  27.92 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4303  peptidase-like  25.94 
 
 		 1289 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0594037  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20066  predicted protein  28.78 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0206  peptidase C1A papain  25.27 
 
 		 797 aa  58.2  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16088  predicted protein  25 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00877055 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94479  predicted protein  27.88 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0456451 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9664  predicted protein  26.24 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.345289  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  30.6 
 
 		 271 aa  56.6  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  30.37 
 
 		 271 aa  57  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  25.91 
 
 		 1236 aa  57  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  29.2 
 
 		 255 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1318  peptidase C1A, papain  25.37 
 
 		 492 aa  55.5  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0624769  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  27.19 
 
 		 789 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1384  hypothetical protein  44.74 
 
 		 341 aa  55.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1038  hypothetical protein  29.17 
 
 		 475 aa  54.7  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  27.83 
 
 		 934 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  25.41 
 
 		 995 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  29.06 
 
 		 1092 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  30.09 
 
 		 255 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.18 
 
 		 2194 aa  51.2  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0559  peptidase C1A papain  26.84 
 
 		 2353 aa  50.8  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.735343  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  31.63 
 
 		 2062 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  25.79 
 
 		 395 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  25.1 
 
 		 698 aa  48.1  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3867  peptidase C1A papain  34.09 
 
 		 640 aa  43.9  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>