108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2326 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  65.87 
 
 
1202 aa  1040    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  100 
 
 
812 aa  1644    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4546  Cna B domain-containing protein  51.14 
 
 
690 aa  163  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0739  Cna B domain-containing protein  35.2 
 
 
536 aa  155  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000604676  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  33.76 
 
 
1096 aa  129  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  35.39 
 
 
354 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  36.44 
 
 
1066 aa  107  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50321  predicted protein  33.33 
 
 
424 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  29.49 
 
 
619 aa  99.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1038  hypothetical protein  33.47 
 
 
475 aa  97.4  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25433  predicted protein  32.54 
 
 
360 aa  96.3  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0222  peptidase C1A, papain  29.89 
 
 
497 aa  91.3  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107237  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0903  peptidase C1A, papain  30.25 
 
 
496 aa  90.5  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3936  Cna B domain-containing protein  38.76 
 
 
330 aa  87.8  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0567855  normal  0.0675553 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  29.54 
 
 
725 aa  87.4  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0559  peptidase C1A papain  31.44 
 
 
2353 aa  85.9  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.735343  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  28.88 
 
 
1236 aa  85.1  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13119  predicted protein  30.24 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.128746  normal  0.100264 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0097  Cna B domain-containing protein  54.55 
 
 
135 aa  80.9  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26082  predicted protein  30.41 
 
 
272 aa  80.9  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0135575 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1673  peptidase C1A, papain  30.8 
 
 
368 aa  77.4  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00360531  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  31.54 
 
 
535 aa  76.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  23.06 
 
 
814 aa  69.7  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45795  predicted protein  28.15 
 
 
666 aa  69.3  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189195  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20066  predicted protein  28.41 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4110  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.97 
 
 
753 aa  68.6  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.61298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  29.2 
 
 
3373 aa  67.4  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0460  FG-GAP repeat-containing protein  28.77 
 
 
2474 aa  66.6  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16088  predicted protein  28.7 
 
 
478 aa  65.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00877055 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.85 
 
 
2182 aa  65.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1679  hypothetical protein  28.91 
 
 
140 aa  64.3  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.213144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  34.65 
 
 
215 aa  63.9  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  29.46 
 
 
305 aa  62.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1596  hypothetical protein  30.49 
 
 
693 aa  63.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000327656  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  28.3 
 
 
820 aa  61.6  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36150  putative collagen-binding protein  28.97 
 
 
727 aa  61.6  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  29 
 
 
303 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  32.08 
 
 
134 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4418  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.88 
 
 
2171 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1022  hypothetical protein  27.76 
 
 
804 aa  60.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2471  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.58 
 
 
1489 aa  60.1  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  28.68 
 
 
307 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  28.04 
 
 
1242 aa  59.3  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3511  hypothetical protein  24.34 
 
 
926 aa  60.1  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.45252 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  27.57 
 
 
1628 aa  58.9  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0109  peptidase C1A papain  27.66 
 
 
308 aa  58.5  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_4995  predicted protein  31.46 
 
 
241 aa  58.2  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.06 
 
 
1451 aa  58.2  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3913  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.92 
 
 
1710 aa  58.2  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806199  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0916  hypothetical protein  26.77 
 
 
288 aa  57.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.964057  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  27.48 
 
 
789 aa  57.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_4741  predicted protein  28.07 
 
 
237 aa  57.8  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16085  predicted protein  23.29 
 
 
550 aa  57  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.659128  hitchhiker  0.00285712 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2620  Cna B domain protein  36.7 
 
 
456 aa  57  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208215  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26660  hypothetical protein  27.39 
 
 
738 aa  57.4  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.794226  normal  0.474919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  26.67 
 
 
1092 aa  56.6  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7559  predicted protein  27.19 
 
 
227 aa  56.6  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  30.84 
 
 
133 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_5520  predicted protein  27.68 
 
 
245 aa  55.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.153526 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0398  hypothetical protein  26.44 
 
 
773 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234868 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  24.83 
 
 
1332 aa  55.1  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39605  predicted protein  30 
 
 
316 aa  54.7  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.673199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  30.41 
 
 
1578 aa  54.7  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0734  cysteine protease  28.21 
 
 
323 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  24.75 
 
 
2656 aa  53.1  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94479  predicted protein  32.09 
 
 
330 aa  53.5  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0456451 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2670  hypothetical protein  28.94 
 
 
680 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.750364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.05 
 
 
1453 aa  53.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0130  peptidase C1A papain  28.94 
 
 
307 aa  52.8  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43432  predicted protein  26.32 
 
 
353 aa  52.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00267457  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_4936  predicted protein  27.8 
 
 
256 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13870  hypothetical protein  34.48 
 
 
132 aa  52.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9664  predicted protein  29.41 
 
 
259 aa  52.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.345289  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  31.39 
 
 
494 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0078  hypothetical protein  35.23 
 
 
129 aa  51.6  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.984341  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3945  hypothetical protein  29.84 
 
 
130 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3054  hypothetical protein  34 
 
 
681 aa  50.8  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000100223  hitchhiker  0.00791247 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1262  secreted protein-like protein  28.57 
 
 
127 aa  50.4  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.23 
 
 
1919 aa  50.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10538  hypothetical protein  52.5 
 
 
370 aa  50.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3311  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.38 
 
 
742 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2055  hypothetical protein  29.13 
 
 
175 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.465998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  31.91 
 
 
130 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1192  hypothetical protein  26.67 
 
 
679 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000450505  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  26.96 
 
 
284 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.89 
 
 
1085 aa  48.9  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0305  preprotein translocase subunit SecD-like protein  24.81 
 
 
571 aa  49.3  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.303617  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6354  hypothetical protein  25.11 
 
 
670 aa  48.5  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4211  lipoprotein, putative  28.35 
 
 
130 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  39.13 
 
 
487 aa  48.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0627  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.88 
 
 
1501 aa  47.8  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3164  Cna B-type  29.31 
 
 
980 aa  47.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592408  normal  0.0320112 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  23.83 
 
 
395 aa  46.6  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  27.44 
 
 
271 aa  46.6  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  27.44 
 
 
271 aa  46.6  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  39.78 
 
 
1407 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1318  peptidase C1A, papain  22.14 
 
 
492 aa  46.2  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0624769  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  28.41 
 
 
5517 aa  46.2  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  29.07 
 
 
316 aa  46.2  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0141  cobaltochelatase  23.26 
 
 
1800 aa  45.4  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>