50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0983 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  100 
 
 		 305 aa  632  1e-180  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0109  peptidase C1A papain  55.52 
 
 		 308 aa  323  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0130  peptidase C1A papain  54.67 
 
 		 307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0734  cysteine protease  53.82 
 
 		 323 aa  316  4e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  51.44 
 
 		 307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  52.51 
 
 		 303 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  45.75 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  33.68 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  32.65 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  33.99 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  33.99 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  33.22 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2646  peptidase C1A papain  32.34 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04739  cysteine protease  25.61 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  29.03 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1250  peptidase C1A papain  29.06 
 
 		 477 aa  72.8  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0216738  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04730  cysteine protease  24.39 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0404654  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  26.36 
 
 		 934 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  24.13 
 
 		 814 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  27.42 
 
 		 535 aa  66.2  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  26.87 
 
 		 1066 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  29.46 
 
 		 812 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  25.66 
 
 		 820 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  30.09 
 
 		 1236 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0222  peptidase C1A, papain  25.87 
 
 		 497 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107237  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  27.51 
 
 		 1202 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0903  peptidase C1A, papain  26.84 
 
 		 496 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0206  peptidase C1A papain  24.26 
 
 		 797 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3515  peptidase C1A papain  23.39 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.071303  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3607  peptidase C1A papain  26.52 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4065  peptidase C1A, papain  25.56 
 
 		 224 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.561338 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2509  hypothetical protein  24.58 
 
 		 364 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  26.36 
 
 		 1242 aa  49.7  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  29.06 
 
 		 354 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2994  peptidase C1A papain  23.17 
 
 		 405 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.766742  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1673  peptidase C1A, papain  22.57 
 
 		 368 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00360531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1038  hypothetical protein  47.92 
 
 		 475 aa  47.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  24.18 
 
 		 1332 aa  47.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  25.52 
 
 		 1628 aa  47.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2639  hypothetical protein  24.41 
 
 		 364 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  39.34 
 
 		 487 aa  45.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25433  predicted protein  26.21 
 
 		 360 aa  45.8  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1306  peptidase C1A, papain  25.11 
 
 		 688 aa  45.8  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0209237  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  21.49 
 
 		 725 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0638  hypothetical protein  27.17 
 
 		 884 aa  45.8  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.102075  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2675  hypothetical protein  28 
 
 		 353 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2547  hypothetical protein  28 
 
 		 353 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  27.69 
 
 		 870 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  22.46 
 
 		 789 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  23.55 
 
 		 494 aa  42.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>