46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1038 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1038  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  983    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  42.37 
 
 		 725 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  41.4 
 
 		 1092 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0559  peptidase C1A papain  42.11 
 
 		 2353 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.735343  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  42.24 
 
 		 1236 aa  319  7.999999999999999e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0222  peptidase C1A, papain  38.48 
 
 		 497 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107237  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0903  peptidase C1A, papain  37.58 
 
 		 496 aa  296  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0305  preprotein translocase subunit SecD-like protein  27.67 
 
 		 571 aa  128  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.303617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  33.07 
 
 		 812 aa  97.4  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  32.13 
 
 		 1096 aa  93.6  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  30.61 
 
 		 1202 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  31.82 
 
 		 1066 aa  81.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26082  predicted protein  25.51 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0135575 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1318  peptidase C1A, papain  28.2 
 
 		 492 aa  68.2  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0624769  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  26.61 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_4995  predicted protein  27.89 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0638  hypothetical protein  30.64 
 
 		 884 aa  60.8  0.00000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.102075  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25433  predicted protein  27.2 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50321  predicted protein  25.1 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  25.09 
 
 		 1242 aa  58.5  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  27.76 
 
 		 1332 aa  56.2  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  25 
 
 		 1628 aa  54.7  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1673  peptidase C1A, papain  25.58 
 
 		 368 aa  54.7  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00360531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  29.17 
 
 		 619 aa  54.7  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0734  cysteine protease  51.06 
 
 		 323 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45795  predicted protein  24.79 
 
 		 666 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189195  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1773  hypothetical protein  25.3 
 
 		 718 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00222697 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0109  peptidase C1A papain  23.05 
 
 		 308 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2509  hypothetical protein  25.51 
 
 		 364 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0145  hypothetical protein  24.25 
 
 		 712 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  24.66 
 
 		 535 aa  49.3  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  45.83 
 
 		 303 aa  48.9  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0130  peptidase C1A papain  41.67 
 
 		 307 aa  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf353  cysteine protease  24.55 
 
 		 787 aa  48.5  0.0003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  25 
 
 		 934 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  29.73 
 
 		 487 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  24.9 
 
 		 307 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  47.92 
 
 		 305 aa  47.4  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2639  hypothetical protein  44 
 
 		 364 aa  47  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20066  predicted protein  24.03 
 
 		 347 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  23.02 
 
 		 814 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  38.18 
 
 		 494 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  25.36 
 
 		 284 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13119  predicted protein  19.63 
 
 		 241 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.128746  normal  0.100264 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  33.02 
 
 		 395 aa  43.5  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  35.29 
 
 		 870 aa  43.1  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>