59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0460 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0460  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 		 2474 aa  4897    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  31.22 
 
 		 2528 aa  337  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0450  hypothetical protein  88.33 
 
 		 171 aa  209  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2497  hypothetical protein  88.33 
 
 		 171 aa  209  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0455  hypothetical protein  26.67 
 
 		 957 aa  99.4  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1478  hypothetical protein  28.89 
 
 		 691 aa  95.9  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  21.4 
 
 		 1608 aa  87.4  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  28.77 
 
 		 812 aa  66.6  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  32.75 
 
 		 974 aa  63.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  33.59 
 
 		 1202 aa  63.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  26.75 
 
 		 1578 aa  63.2  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  28.53 
 
 		 1126 aa  62.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  25.41 
 
 		 5743 aa  60.5  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2670  hypothetical protein  26.17 
 
 		 680 aa  57.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.750364 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16659  predicted protein  32.23 
 
 		 742 aa  54.7  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  23.33 
 
 		 2194 aa  53.9  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3677  FG-GAP repeat-containing protein  25.52 
 
 		 639 aa  53.9  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.431632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.72 
 
 		 1340 aa  53.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  34.18 
 
 		 791 aa  52.8  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.6 
 
 		 891 aa  52.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  27.14 
 
 		 1019 aa  52  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.79 
 
 		 1225 aa  51.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  23.21 
 
 		 2807 aa  52  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1596  hypothetical protein  25.79 
 
 		 693 aa  51.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000327656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  28.72 
 
 		 469 aa  51.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0627  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.9 
 
 		 1501 aa  51.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  40.43 
 
 		 747 aa  51.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  28.12 
 
 		 1275 aa  50.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  28 
 
 		 3373 aa  50.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  25.68 
 
 		 760 aa  50.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0739  Cna B domain-containing protein  27.78 
 
 		 536 aa  50.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000604676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4546  Cna B domain-containing protein  32.95 
 
 		 690 aa  50.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26660  hypothetical protein  29.5 
 
 		 738 aa  50.1  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.794226  normal  0.474919 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  41.54 
 
 		 833 aa  50.1  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  24.36 
 
 		 3197 aa  50.1  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  28.71 
 
 		 616 aa  49.7  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  25.63 
 
 		 1838 aa  49.7  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  26.71 
 
 		 1490 aa  48.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  26.87 
 
 		 1976 aa  48.9  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  26.89 
 
 		 828 aa  49.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3054  hypothetical protein  29 
 
 		 681 aa  48.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000100223  hitchhiker  0.00791247 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  28.88 
 
 		 561 aa  48.9  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5514  hypothetical protein  32.22 
 
 		 1504 aa  49.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2985  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.38 
 
 		 620 aa  48.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  37.29 
 
 		 1087 aa  48.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3122  Integrins alpha chain  24.78 
 
 		 254 aa  48.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0941302  hitchhiker  0.000197077 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  28.46 
 
 		 1557 aa  48.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  26.09 
 
 		 2656 aa  47.4  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  39.13 
 
 		 807 aa  47.8  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.61 
 
 		 1118 aa  47  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1289 aa  47  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 		 781 aa  47  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1192  hypothetical protein  24.84 
 
 		 679 aa  47  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000450505  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  20.66 
 
 		 1951 aa  47  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.87 
 
 		 1222 aa  46.6  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4110  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  25.89 
 
 		 753 aa  46.6  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.61298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1023  hypothetical protein  32.12 
 
 		 980 aa  46.2  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 1089 aa  46.2  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 935 aa  45.8  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>