50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0739 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0739  Cna B domain-containing protein  100 
 
 		 536 aa  983    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000604676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  39.45 
 
 		 1202 aa  258  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  37.94 
 
 		 812 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3936  Cna B domain-containing protein  45.36 
 
 		 330 aa  140  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0567855  normal  0.0675553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4110  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.01 
 
 		 753 aa  90.9  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.61298 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4546  Cna B domain-containing protein  40.72 
 
 		 690 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  31.06 
 
 		 3373 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36150  putative collagen-binding protein  32.05 
 
 		 727 aa  81.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  35.14 
 
 		 1578 aa  80.1  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0756  cobaltochelatase subunit CobN  26.7 
 
 		 2168 aa  74.7  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2572  hypothetical protein  35.68 
 
 		 333 aa  72.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  27.21 
 
 		 2656 aa  71.6  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  27.96 
 
 		 1337 aa  63.9  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  27.96 
 
 		 1337 aa  63.9  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  28.38 
 
 		 5517 aa  63.9  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04230  Cna B domain protein  36.6 
 
 		 609 aa  63.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2620  Cna B domain protein  36.17 
 
 		 456 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208215  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0460  FG-GAP repeat-containing protein  29.62 
 
 		 2474 aa  62.4  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  31.42 
 
 		 3562 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  26.98 
 
 		 2604 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26660  hypothetical protein  30.37 
 
 		 738 aa  57.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.794226  normal  0.474919 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1481  cobaltochelatase  24.51 
 
 		 2110 aa  57.4  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3497  hypothetical protein  35.56 
 
 		 1170 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  22.97 
 
 		 1508 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  25.13 
 
 		 3278 aa  54.3  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1258  Subtilisin-like serine protease  27.88 
 
 		 1937 aa  52.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.596545  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  32.78 
 
 		 5203 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0310  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  25 
 
 		 2073 aa  52  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0097  Cna B domain-containing protein  41.98 
 
 		 135 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1517  cobaltochelatase subunit CobN  26.75 
 
 		 1758 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.254627  hitchhiker  0.000129618 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  31.14 
 
 		 1153 aa  51.2  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  31.14 
 
 		 1153 aa  51.2  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0911  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  23.44 
 
 		 632 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0440438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2129  S-layer-like domain-containing protein  29.52 
 
 		 1304 aa  50.4  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00431402  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0141  cobaltochelatase  29.15 
 
 		 1800 aa  50.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.59 
 
 		 749 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3292  Cna B domain protein  43.28 
 
 		 320 aa  49.3  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  28.38 
 
 		 1243 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  29.36 
 
 		 4106 aa  48.5  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  24.63 
 
 		 1380 aa  47.4  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5207  collagen adhesion protein, C-terminal  25.78 
 
 		 882 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1769  cobaltochelatase  29.12 
 
 		 1801 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.045286  normal  0.0158644 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0524  hypothetical protein  26.71 
 
 		 463 aa  46.2  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.195293 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  25.51 
 
 		 3392 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  25.05 
 
 		 3393 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1727 aa  44.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3054  hypothetical protein  30.37 
 
 		 681 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000100223  hitchhiker  0.00791247 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 650 aa  43.9  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  43.84 
 
 		 983 aa  43.9  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  36.9 
 
 		 795 aa  43.5  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>