19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0097 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0097  Cna B domain-containing protein  100 
 
 
135 aa  268  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4546  Cna B domain-containing protein  64.17 
 
 
690 aa  143  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  60.27 
 
 
1202 aa  83.6  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  54.55 
 
 
812 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0739  Cna B domain-containing protein  41.98 
 
 
536 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000604676  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2620  Cna B domain protein  40 
 
 
456 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208215  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3936  Cna B domain-containing protein  37.36 
 
 
330 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0567855  normal  0.0675553 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  43.75 
 
 
1672 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1863  hypothetical protein  43.48 
 
 
409 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 
798 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  39.29 
 
 
988 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1258  Subtilisin-like serine protease  32.63 
 
 
1937 aa  41.6  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.596545  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0398  hypothetical protein  53.06 
 
 
773 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234868 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  32.94 
 
 
788 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3327  metallophosphoesterase  41.27 
 
 
492 aa  40.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3511  hypothetical protein  42.31 
 
 
926 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.45252 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  36.36 
 
 
753 aa  40.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05170  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.24 
 
 
653 aa  40.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  40.26 
 
 
924 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>