More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3936 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  100 
 
 		 650 aa  1266    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  60.06 
 
 		 678 aa  731    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  50.44 
 
 		 523 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  45.55 
 
 		 499 aa  382  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  53.15 
 
 		 492 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  47 
 
 		 506 aa  375  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  49.62 
 
 		 457 aa  368  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  43.91 
 
 		 494 aa  369  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  50.94 
 
 		 482 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  43.16 
 
 		 485 aa  363  4e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  45.49 
 
 		 643 aa  360  6e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  49.33 
 
 		 517 aa  359  7e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  45.49 
 
 		 643 aa  359  8e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  45.49 
 
 		 643 aa  359  8e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  50.47 
 
 		 512 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  47.85 
 
 		 504 aa  348  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  45.81 
 
 		 487 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  43.04 
 
 		 503 aa  324  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  45.09 
 
 		 494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  40.22 
 
 		 492 aa  298  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  41.42 
 
 		 480 aa  280  5e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  41.51 
 
 		 476 aa  271  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  37.68 
 
 		 491 aa  255  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  37.36 
 
 		 487 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  36.87 
 
 		 488 aa  241  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 		 485 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  39.3 
 
 		 484 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  37.64 
 
 		 482 aa  228  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 474 aa  225  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.27 
 
 		 449 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  36.88 
 
 		 489 aa  197  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 548 aa  195  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 487 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  35.99 
 
 		 487 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 487 aa  194  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  36.25 
 
 		 498 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 		 484 aa  191  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  29 
 
 		 471 aa  189  2e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 477 aa  188  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  34.07 
 
 		 500 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  30.97 
 
 		 477 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 479 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 		 474 aa  178  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 		 472 aa  176  9e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 475 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 473 aa  170  6e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 473 aa  170  8e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 487 aa  167  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 491 aa  168  4e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2371  major facilitator superfamily MFS_1  35.17 
 
 		 472 aa  163  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130486  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2303  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 		 463 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  32.7 
 
 		 483 aa  160  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.58 
 
 		 592 aa  154  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 502 aa  150  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.49 
 
 		 522 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.09 
 
 		 569 aa  144  7e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.78 
 
 		 521 aa  143  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.74 
 
 		 515 aa  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.74 
 
 		 515 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.54 
 
 		 524 aa  141  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.07 
 
 		 537 aa  139  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 489 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 464 aa  137  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29 
 
 		 482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.39 
 
 		 607 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.48 
 
 		 510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  27.58 
 
 		 522 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.32 
 
 		 678 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.6 
 
 		 528 aa  130  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.79 
 
 		 534 aa  130  9.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 		 525 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.34 
 
 		 607 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 494 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.12 
 
 		 523 aa  128  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.07 
 
 		 666 aa  128  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.01 
 
 		 517 aa  127  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  26.77 
 
 		 467 aa  126  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4580  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 473 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.09 
 
 		 527 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.09 
 
 		 527 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.56 
 
 		 579 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.83 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.77 
 
 		 527 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.29 
 
 		 504 aa  125  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.9 
 
 		 510 aa  125  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 470 aa  125  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.1 
 
 		 478 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.9 
 
 		 503 aa  124  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 		 534 aa  124  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5588  putative multidrug resistance protein, emrB-like protein  28.42 
 
 		 525 aa  124  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339055  normal  0.392852 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.32 
 
 		 465 aa  124  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28 
 
 		 502 aa  124  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.52 
 
 		 680 aa  124  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.79 
 
 		 539 aa  123  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.81 
 
 		 534 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.22 
 
 		 635 aa  123  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.9 
 
 		 658 aa  122  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.44 
 
 		 531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.38 
 
 		 532 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>