42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1222 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  100 
 
 		 130 aa  263  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1442  hypothetical protein  60.32 
 
 		 190 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4279  secreted protein-like protein  60.32 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4363  putative lipoprotein  53.91 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144177  normal  0.0276166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3945  hypothetical protein  56.35 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1079  putative lipoprotein  60.53 
 
 		 130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4211  lipoprotein, putative  55.12 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  54.33 
 
 		 133 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4580  hypothetical protein  58.1 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13870  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  134  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  52.34 
 
 		 134 aa  133  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2202  secreted protein-like protein  34.69 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0706  hypothetical protein  37.23 
 
 		 201 aa  60.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1461  putative lipoprotein  36.96 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.093492  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  35.14 
 
 		 745 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  35.14 
 
 		 746 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  33.78 
 
 		 745 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  35.11 
 
 		 215 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1679  hypothetical protein  25.98 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.213144 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1262  secreted protein-like protein  28.57 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2681  secreted protein-like  30.97 
 
 		 412 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.593103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0066  hypothetical protein  37.11 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0701675 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2068  hypothetical protein  33.7 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1239  lipoprotein  31.11 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.619168  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  34.51 
 
 		 1202 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4035  hypothetical protein  32.29 
 
 		 176 aa  51.2  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0916  hypothetical protein  30.93 
 
 		 288 aa  50.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.964057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1927  hypothetical protein  26.47 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000111149  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1242  hypothetical protein  31.25 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  33.77 
 
 		 741 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1409  secreted protein  28.18 
 
 		 269 aa  49.7  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.894228  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1242  hypothetical protein  31.25 
 
 		 123 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  30.23 
 
 		 316 aa  47.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0675  hypothetical protein  32.94 
 
 		 246 aa  47  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.994925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0078  hypothetical protein  36 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.984341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2108  secreted protein-like protein  29.47 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  31.91 
 
 		 812 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2464  hypothetical protein  28.85 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0711042  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0929  hypothetical protein  31 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0056852 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1893  hypothetical protein  34.52 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.479923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4152  hypothetical protein  28.04 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337445  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5290  Proteinase inhibitor I42, chagasin  29.03 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.440506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>