16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2675 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2675  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  730    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2547  hypothetical protein  99.43 
 
 
353 aa  726    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2509  hypothetical protein  44.08 
 
 
364 aa  247  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2639  hypothetical protein  43.75 
 
 
364 aa  229  4e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  24.92 
 
 
814 aa  53.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1250  peptidase C1A papain  24.92 
 
 
477 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0216738  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  23.16 
 
 
271 aa  47.4  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  23.16 
 
 
271 aa  47.4  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  23.38 
 
 
870 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  37.1 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  28 
 
 
305 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  23.4 
 
 
535 aa  43.9  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0734  cysteine protease  23.55 
 
 
323 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  21.53 
 
 
307 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  20.29 
 
 
395 aa  43.9  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0130  peptidase C1A papain  41.18 
 
 
307 aa  43.1  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>