23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4188 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4188  peptidase C1A papain  100 
 
 		 599 aa  1238    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  33.77 
 
 		 820 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  33.01 
 
 		 789 aa  207  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  35.15 
 
 		 535 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  25.08 
 
 		 487 aa  74.3  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0145  hypothetical protein  26.86 
 
 		 712 aa  73.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1773  hypothetical protein  23.88 
 
 		 718 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00222697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  23.16 
 
 		 494 aa  58.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04739  cysteine protease  22.41 
 
 		 270 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  24.89 
 
 		 1242 aa  54.7  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  26.38 
 
 		 1628 aa  53.9  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  23.75 
 
 		 284 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04730  cysteine protease  22.39 
 
 		 312 aa  51.2  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0404654  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  25.97 
 
 		 255 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  25.1 
 
 		 934 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  24.22 
 
 		 255 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  20.78 
 
 		 271 aa  46.2  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  20.78 
 
 		 271 aa  46.2  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  21.07 
 
 		 272 aa  45.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  23.02 
 
 		 1332 aa  45.4  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  33.93 
 
 		 354 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9664  predicted protein  30 
 
 		 259 aa  44.3  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.345289  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  31.51 
 
 		 814 aa  43.5  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.590308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>