61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0620 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0620  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  718    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.611979  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0648  Fibronectin type III domain protein  48.36 
 
 		 972 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  52.13 
 
 		 1628 aa  155  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  43.9 
 
 		 1242 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  35.84 
 
 		 1332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  40.19 
 
 		 804 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  39.44 
 
 		 1025 aa  105  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0688  Fibronectin type III domain protein  28.5 
 
 		 513 aa  96.3  7e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  29.57 
 
 		 831 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  33.19 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  31 
 
 		 820 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  29.91 
 
 		 805 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  25.77 
 
 		 892 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  32.74 
 
 		 1200 aa  64.3  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  29.34 
 
 		 1056 aa  64.3  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  26.25 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  25.37 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.15 
 
 		 458 aa  59.7  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  32.52 
 
 		 641 aa  59.7  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  31.43 
 
 		 940 aa  59.7  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  28.62 
 
 		 471 aa  56.6  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  31.43 
 
 		 735 aa  53.5  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  33.33 
 
 		 500 aa  53.1  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  25.76 
 
 		 648 aa  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  24.24 
 
 		 439 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  22.34 
 
 		 417 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.85 
 
 		 510 aa  51.2  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  27.27 
 
 		 647 aa  50.4  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  30.77 
 
 		 899 aa  50.4  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4470  periplasmic copper-binding  24.89 
 
 		 446 aa  50.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  26.07 
 
 		 467 aa  50.1  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  24.24 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  24.24 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1567  periplasmic copper-binding  32.77 
 
 		 452 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0198454  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  24.23 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  25.76 
 
 		 457 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  28.65 
 
 		 422 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  27.51 
 
 		 595 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  25.07 
 
 		 441 aa  47.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  24.83 
 
 		 425 aa  47  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  33.01 
 
 		 1980 aa  47  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  27.57 
 
 		 437 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  28.73 
 
 		 707 aa  47  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  22.3 
 
 		 459 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  35.86 
 
 		 570 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.75 
 
 		 467 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20190  copper ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.48 
 
 		 428 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00197549  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1737  nitrous oxide reductase maturation protein NosD  23.48 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  35.42 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1510  periplasmic copper-binding  28.57 
 
 		 505 aa  43.9  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163469  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  29.41 
 
 		 677 aa  43.9  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0271  periplasmic copper-binding protein  41.25 
 
 		 743 aa  43.9  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.819946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0434  Serine/threonine protein kinase  24.52 
 
 		 674 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000341904  normal  0.409693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  27.65 
 
 		 375 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  29.46 
 
 		 810 aa  43.1  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  26.43 
 
 		 439 aa  42.7  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  23.88 
 
 		 446 aa  42.7  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  25.11 
 
 		 429 aa  42.7  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0276  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  28.32 
 
 		 464 aa  42.7  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.189297  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  28.47 
 
 		 1931 aa  42.7  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0252  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  28.32 
 
 		 464 aa  42.7  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>