41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1938 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1938  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 369 aa  737    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0578  parallel beta-helix repeat-containing protein  53.51 
 
 		 364 aa  360  2e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.56022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.35 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  27.83 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1737  nitrous oxide reductase maturation protein NosD  28.11 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.18 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20190  copper ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.11 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00197549  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1931  nitrous oxidase accessory protein-like protein  28.04 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  24.55 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.49 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  26.84 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  25.67 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  25.78 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  27.14 
 
 		 483 aa  56.2  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  23.1 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  24.24 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  21.98 
 
 		 423 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  21.98 
 
 		 423 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  27.66 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  24.16 
 
 		 431 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  24.16 
 
 		 431 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1163  periplasmic copper-binding  27.81 
 
 		 503 aa  52.8  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  23.18 
 
 		 454 aa  53.1  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  23.73 
 
 		 432 aa  52.8  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  23.81 
 
 		 422 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  23.95 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  22.89 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  23.95 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  23.95 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  23.95 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  23.11 
 
 		 437 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  22.55 
 
 		 400 aa  50.1  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4345  periplasmic copper-binding  23.19 
 
 		 462 aa  50.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  24.37 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  23.51 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  23.7 
 
 		 467 aa  46.6  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  22.18 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  21.82 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0355  periplasmic copper-binding  20.85 
 
 		 452 aa  43.9  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  24.2 
 
 		 454 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  22.46 
 
 		 439 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>