18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28530 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_28530  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  719    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0528408  normal  0.0603049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7283  hypothetical protein  48.29 
 
 		 377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.581256  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0761  hypothetical protein  41.3 
 
 		 363 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.842427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7141  coagulation factor 5/8 type domain protein  40 
 
 		 538 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3238  hypothetical protein  30.13 
 
 		 652 aa  113  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359216  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2261  hypothetical protein  29.58 
 
 		 832 aa  94.4  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000443628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2044  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.13 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.039257  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2985  hypothetical protein  28.95 
 
 		 667 aa  60.1  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000400495  hitchhiker  0.00618409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2599  hypothetical protein  27.54 
 
 		 820 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  34.09 
 
 		 442 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1515  hypothetical protein  33.85 
 
 		 586 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000161589  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.07 
 
 		 467 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2544  hypothetical protein  27.65 
 
 		 465 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.103402  normal  0.0339199 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  22.81 
 
 		 510 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  29.13 
 
 		 665 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3152  conserved repeat domain protein  34.82 
 
 		 1716 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4433  hypothetical protein  32.26 
 
 		 366 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.696771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  27.78 
 
 		 505 aa  42.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>