9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2544 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2544  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  935    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.103402  normal  0.0339199 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0106  hypothetical protein  57.99 
 
 		 460 aa  485  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1546  hypothetical protein  50.57 
 
 		 463 aa  413  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2513  hypothetical protein  44.51 
 
 		 392 aa  295  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.929693  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3337  Parallel beta-helix repeat  31.21 
 
 		 537 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.142831 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2599  hypothetical protein  30.22 
 
 		 820 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28530  hypothetical protein  27.65 
 
 		 364 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0528408  normal  0.0603049 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0255  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  22.81 
 
 		 740 aa  47.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.651298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1515  hypothetical protein  30.16 
 
 		 586 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000161589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>