24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3152 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3152  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 1716 aa  3323    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3244  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.81 
 
 		 1829 aa  303  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.443436  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3732  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.23 
 
 		 1822 aa  272  4e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3733  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1439 aa  92  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0786  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.46 
 
 		 711 aa  90.5  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.67 
 
 		 1800 aa  89.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1240  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.33 
 
 		 717 aa  86.7  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.516491 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4856  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1315 aa  85.9  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212334  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  30.4 
 
 		 1980 aa  65.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3077  hypothetical protein  27.34 
 
 		 755 aa  64.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0518712  normal  0.893514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3245  hypothetical protein  41.6 
 
 		 1439 aa  59.3  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  47.87 
 
 		 412 aa  58.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  48.89 
 
 		 717 aa  56.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3153  hypothetical protein  32.66 
 
 		 1238 aa  54.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1462  APHP domain protein  40 
 
 		 1378 aa  53.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1576  hypothetical protein  28.87 
 
 		 388 aa  50.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  30.86 
 
 		 2000 aa  48.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0642  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.3 
 
 		 2281 aa  48.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  28.66 
 
 		 1193 aa  48.9  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0752  conserved repeat domain-containing protein  26.79 
 
 		 897 aa  47  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.389587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1144  hypothetical protein  33.19 
 
 		 271 aa  46.6  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.069789 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  30.51 
 
 		 940 aa  46.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2876  membrane protein  27.04 
 
 		 277 aa  45.8  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3132  polymorphic membrane protein  43.48 
 
 		 546 aa  45.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>