21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3732 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3244  parallel beta-helix repeat-containing protein  84.46 
 
 		 1829 aa  2967    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.443436  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3732  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 1822 aa  3556    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976047 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3152  conserved repeat domain protein  33.07 
 
 		 1716 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0786  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.44 
 
 		 711 aa  137  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.78 
 
 		 1800 aa  133  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3733  hypothetical protein  31.95 
 
 		 1439 aa  131  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1240  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.19 
 
 		 717 aa  120  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.516491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3245  hypothetical protein  31.44 
 
 		 1439 aa  115  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4856  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1315 aa  93.2  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212334  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0886  hypothetical protein  27.89 
 
 		 631 aa  82.8  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.57162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3077  hypothetical protein  26.64 
 
 		 755 aa  76.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0518712  normal  0.893514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0642  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.37 
 
 		 2281 aa  71.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3153  hypothetical protein  26.26 
 
 		 1238 aa  65.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  32.86 
 
 		 1980 aa  63.9  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  46.34 
 
 		 4672 aa  58.2  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  28.41 
 
 		 1193 aa  57.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0756  hypothetical protein  24.76 
 
 		 492 aa  50.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0343  hypothetical protein  29.88 
 
 		 1802 aa  47  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.691393 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  24.42 
 
 		 8918 aa  46.6  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  40.51 
 
 		 2434 aa  45.8  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1521  conserved repeat domain protein  34.39 
 
 		 435 aa  45.8  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000177441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>