19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3733 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3245  hypothetical protein  81.51 
 
 		 1439 aa  2254    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3733  hypothetical protein  100 
 
 		 1439 aa  2804    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3732  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.95 
 
 		 1822 aa  128  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976047 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3153  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1238 aa  123  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1240  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.59 
 
 		 717 aa  115  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.516491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3244  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.03 
 
 		 1829 aa  114  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.443436  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0786  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.14 
 
 		 711 aa  104  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.69 
 
 		 1800 aa  102  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4856  hypothetical protein  30.75 
 
 		 1315 aa  96.3  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212334  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  29.26 
 
 		 1980 aa  76.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0886  hypothetical protein  28.65 
 
 		 631 aa  68.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.57162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3152  conserved repeat domain protein  41.09 
 
 		 1716 aa  59.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 1121 aa  55.5  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28540  hypothetical protein  27.35 
 
 		 739 aa  50.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00808875  normal  0.0849001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3077  hypothetical protein  26.43 
 
 		 755 aa  48.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0518712  normal  0.893514 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5474  hypothetical protein  27.01 
 
 		 460 aa  48.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0456  Parallel beta-helix repeat protein  30.24 
 
 		 2615 aa  46.6  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0642  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.79 
 
 		 2281 aa  45.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  24.04 
 
 		 1931 aa  45.1  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>