15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0456 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0456  Parallel beta-helix repeat protein  100 
 
 		 2615 aa  5011    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1665  Ig-like protein, group 2  47.01 
 
 		 462 aa  193  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0449982 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3846  Parallel beta-helix repeat protein  30.72 
 
 		 1562 aa  150  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02350  putative zinc metalloendopeptidase  42.98 
 
 		 269 aa  150  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2976  hypothetical protein  29.08 
 
 		 1304 aa  145  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0133  Parallel beta-helix repeat protein  29.43 
 
 		 1873 aa  107  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0130  hypothetical protein  29.32 
 
 		 1985 aa  107  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111075 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0112  cyclin domain-containing protein  25.12 
 
 		 770 aa  59.7  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0591  hypothetical protein  28.05 
 
 		 719 aa  57.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.519153  normal  0.291994 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27491  hypothetical protein  28.57 
 
 		 387 aa  50.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1434  carbamoyl-phosphate synthase L chain  43.33 
 
 		 348 aa  48.9  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0970614  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0590  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.88 
 
 		 675 aa  48.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1591  carbamoyl-phosphate synthase L chain  45 
 
 		 316 aa  47  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27041  hypothetical protein  24.61 
 
 		 357 aa  46.6  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3733  hypothetical protein  30.24 
 
 		 1439 aa  45.8  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226773 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>