46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1665 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1665  Ig-like protein, group 2  100 
 
 		 462 aa  925    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0449982 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0456  Parallel beta-helix repeat protein  47.01 
 
 		 2615 aa  193  7e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02350  putative zinc metalloendopeptidase  37.8 
 
 		 269 aa  108  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  47.62 
 
 		 1193 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  42.66 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  38.55 
 
 		 1821 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  37.93 
 
 		 1009 aa  69.7  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  34.38 
 
 		 1300 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  39.29 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  30.07 
 
 		 4630 aa  63.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  47.47 
 
 		 1937 aa  60.5  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  50 
 
 		 1732 aa  60.5  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  47.47 
 
 		 1467 aa  60.5  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  34.97 
 
 		 981 aa  60.5  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  30.88 
 
 		 2638 aa  58.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  37.68 
 
 		 570 aa  57.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  45.05 
 
 		 600 aa  56.6  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  47.06 
 
 		 526 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  38.2 
 
 		 556 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  28.65 
 
 		 1279 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  30.37 
 
 		 1077 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  42.42 
 
 		 554 aa  51.2  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1966  hypothetical protein  40.24 
 
 		 524 aa  50.1  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3488  Ig domain protein group 2 domain protein  43.94 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  30.66 
 
 		 536 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1889  Ig domain-containing protein  28.19 
 
 		 331 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2464  surface protein, putative  33.33 
 
 		 799 aa  47.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0371  Ig domain-containing protein  23.87 
 
 		 472 aa  47.4  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2284  Ig-like, group 2  32.39 
 
 		 201 aa  47.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2198  phage tail protein  42.86 
 
 		 306 aa  46.6  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  39.73 
 
 		 1048 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1738  Ig domain-containing protein  36.51 
 
 		 316 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  29.17 
 
 		 1831 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  27.59 
 
 		 1361 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2318  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  60 
 
 		 771 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.848662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  32.79 
 
 		 2172 aa  45.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  41.86 
 
 		 1226 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3510  Ig domain-containing protein  30 
 
 		 811 aa  44.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000494417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6274  Ig domain protein group 2 domain protein  34.78 
 
 		 867 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.887369 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  34.02 
 
 		 1418 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2125  Ig domain-containing protein  23.23 
 
 		 472 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3370  Ig domain-containing protein  32.35 
 
 		 389 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  30.23 
 
 		 576 aa  44.3  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  33.72 
 
 		 299 aa  43.9  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  33.94 
 
 		 2042 aa  43.1  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  35.09 
 
 		 382 aa  43.1  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>