15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0133 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0133  Parallel beta-helix repeat protein  100 
 
 
1873 aa  3583    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0130  hypothetical protein  85.19 
 
 
1985 aa  2466    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000111075 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2976  hypothetical protein  30.87 
 
 
1304 aa  170  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3846  Parallel beta-helix repeat protein  28.25 
 
 
1562 aa  146  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0456  Parallel beta-helix repeat protein  29.43 
 
 
2615 aa  113  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  31.24 
 
 
3131 aa  61.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  31.03 
 
 
3141 aa  60.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  28.95 
 
 
3144 aa  59.3  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0590  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.08 
 
 
675 aa  52.4  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1533  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.54 
 
 
1251 aa  52.4  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0728  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.49 
 
 
1256 aa  51.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.23429  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0591  hypothetical protein  24.91 
 
 
719 aa  50.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.519153  normal  0.291994 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2611  hypothetical protein  24.01 
 
 
2924 aa  47.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  24.34 
 
 
5212 aa  47  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  24.24 
 
 
3443 aa  45.8  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.443452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>