14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5474 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5474  hypothetical protein  100 
 
 		 460 aa  912    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  27.03 
 
 		 759 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.96 
 
 		 1066 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  26.7 
 
 		 677 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.11 
 
 		 428 aa  57  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.61 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  30.94 
 
 		 565 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0412  Parallel beta-helix repeat protein  31.75 
 
 		 468 aa  51.2  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.46 
 
 		 510 aa  49.7  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  26.11 
 
 		 665 aa  47  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2575  Parallel beta-helix repeat protein  29.13 
 
 		 495 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5086  hypothetical protein  27.99 
 
 		 421 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3244  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.48 
 
 		 1829 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.443436  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0292  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.74 
 
 		 463 aa  43.5  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>