21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0886 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0886  hypothetical protein  100 
 
 		 631 aa  1283    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.57162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3677  FG-GAP repeat-containing protein  40.54 
 
 		 639 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.431632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1308  hypothetical protein  43.36 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0786  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.58 
 
 		 711 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3244  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.24 
 
 		 1829 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.443436  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3732  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.63 
 
 		 1822 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3733  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1439 aa  63.9  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1240  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.5 
 
 		 717 aa  62  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.516491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2010  calx-beta domain-containg protein  35.48 
 
 		 601 aa  60.8  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  35.4 
 
 		 1418 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  44.44 
 
 		 2310 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  39.64 
 
 		 2305 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  35.96 
 
 		 4013 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3245  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1439 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883783 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.23 
 
 		 1340 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3078  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.16 
 
 		 469 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  30 
 
 		 1222 aa  49.3  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  30.49 
 
 		 8871 aa  49.7  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3153  hypothetical protein  28.46 
 
 		 1238 aa  48.9  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.29 
 
 		 1180 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  46.88 
 
 		 2251 aa  45.8  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>