15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0129 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0129  hypothetical protein  100 
 
 
587 aa  1209    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0130  hypothetical protein  71.93 
 
 
568 aa  813    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  48.72 
 
 
958 aa  464  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  49.63 
 
 
869 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0105  Parallel beta-helix repeat protein  45.37 
 
 
609 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.28403  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  38.95 
 
 
1799 aa  310  4e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1542  hypothetical protein  39.11 
 
 
458 aa  289  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.218031  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0103  hypothetical protein  40.26 
 
 
684 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  37.47 
 
 
1262 aa  238  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0677  hypothetical protein  33.18 
 
 
486 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0395736  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0672  hypothetical protein  32.93 
 
 
550 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.165731  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0673  APHP domain-containing protein  31.22 
 
 
857 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  27.13 
 
 
916 aa  128  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1386  hypothetical protein  25.48 
 
 
494 aa  103  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.556451  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0671  hypothetical protein  39.76 
 
 
119 aa  50.4  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.485621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>