15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0677 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0673  APHP domain-containing protein  70.37 
 
 
857 aa  701    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0677  hypothetical protein  100 
 
 
486 aa  1002    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0395736  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0672  hypothetical protein  66.45 
 
 
550 aa  627  1e-178  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.165731  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1542  hypothetical protein  37.32 
 
 
458 aa  212  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.218031  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  34.72 
 
 
1799 aa  195  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  35.85 
 
 
958 aa  188  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  33.85 
 
 
1262 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0129  hypothetical protein  32.37 
 
 
587 aa  178  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0130  hypothetical protein  30.56 
 
 
568 aa  177  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  31.31 
 
 
869 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  30.2 
 
 
916 aa  162  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0105  Parallel beta-helix repeat protein  32.4 
 
 
609 aa  162  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.28403  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0103  hypothetical protein  27.98 
 
 
684 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1386  hypothetical protein  28.83 
 
 
494 aa  87.4  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.556451  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0671  hypothetical protein  67.31 
 
 
119 aa  64.3  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.485621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>