40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7522 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7522  hypothetical protein  100 
 
 
807 aa  1607    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.856232  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2429  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.73 
 
 
372 aa  101  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2293  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.32 
 
 
372 aa  100  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4400  hypothetical protein  26.8 
 
 
423 aa  98.6  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0913462  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3715  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.35 
 
 
563 aa  95.5  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4103  hypothetical protein  27.87 
 
 
424 aa  89.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0792  hypothetical protein  25.15 
 
 
431 aa  89.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.992362  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0716  putative lipoprotein  26.85 
 
 
421 aa  88.6  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0434  putative lipoprotein  26.85 
 
 
421 aa  88.6  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1151  putative lipoprotein  26.85 
 
 
421 aa  88.6  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.403494  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1320  putative lipoprotein  26.85 
 
 
420 aa  88.2  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1808  putative lipoprotein  26.85 
 
 
420 aa  88.6  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00934071  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1813  hypothetical protein  27.64 
 
 
429 aa  87.4  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.679097  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1457  putative lipoprotein  26.51 
 
 
419 aa  87.4  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1311  putative lipoprotein  26.17 
 
 
420 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3628  hypothetical protein  27.46 
 
 
424 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174026  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1348  hypothetical protein  27.2 
 
 
364 aa  64.3  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1329  hypothetical protein  26.8 
 
 
376 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1312  hypothetical protein  26.8 
 
 
359 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3618  hypothetical protein  28.95 
 
 
547 aa  56.6  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.216975 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2384  hypothetical protein  31.85 
 
 
415 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.458902  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0826  hypothetical protein  23.2 
 
 
470 aa  55.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.114737  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0833  hypothetical protein  25.5 
 
 
451 aa  50.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000168293  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2286  hypothetical protein  34.85 
 
 
647 aa  50.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959079  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  27.16 
 
 
1000 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1336  PKD domain containing protein  24.57 
 
 
567 aa  50.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  26 
 
 
916 aa  49.7  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0810  hypothetical protein  54.35 
 
 
464 aa  49.7  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  23 
 
 
998 aa  47.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.33 
 
 
1212 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  23.42 
 
 
1403 aa  46.2  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.42 
 
 
1109 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3444  hypothetical protein  53.49 
 
 
622 aa  45.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.623137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3592  hypothetical protein  24.77 
 
 
528 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237633  normal  0.778386 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08480  conserved hypothetical protein  40.62 
 
 
1380 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.1497  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  22.33 
 
 
998 aa  45.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  25.42 
 
 
1091 aa  45.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00550  conserved hypothetical protein  35.53 
 
 
1380 aa  44.7  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.487463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3991  hypothetical protein  59.52 
 
 
635 aa  44.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000697572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4658  mycodextranase  25.27 
 
 
671 aa  44.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575597  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>