51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1598 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1598  hypothetical protein  100 
 
 
675 aa  1341    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000695683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  49.74 
 
 
1394 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  40.56 
 
 
453 aa  135  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4466  hypothetical protein  35.62 
 
 
412 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0404  hypothetical protein  33.46 
 
 
776 aa  118  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321562  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  38.41 
 
 
456 aa  114  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  67.38 
 
 
1159 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  53.38 
 
 
830 aa  92  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  47.01 
 
 
916 aa  82  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  28.9 
 
 
495 aa  75.1  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  71.95 
 
 
793 aa  70.9  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0886  hypothetical protein  30.18 
 
 
827 aa  70.5  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  40.4 
 
 
671 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1750  hypothetical protein  28.75 
 
 
315 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489319  normal  0.427262 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2520  NAD+ synthase  27.45 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  48.48 
 
 
778 aa  67.8  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  42.14 
 
 
455 aa  65.1  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30179  hypothetical protein  36.22 
 
 
617 aa  65.1  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  45.8 
 
 
625 aa  63.9  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  31.19 
 
 
2272 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  34.53 
 
 
2313 aa  60.8  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  43.66 
 
 
2353 aa  59.7  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2837  hypothetical protein  25.65 
 
 
320 aa  59.3  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1954  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.83 
 
 
570 aa  58.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.614483  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  31.13 
 
 
2179 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00791  Rhs family protein  25.14 
 
 
471 aa  57  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0158611  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  50.68 
 
 
433 aa  56.2  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  37.57 
 
 
846 aa  54.7  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  56.25 
 
 
914 aa  54.7  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2777  hypothetical protein  41.23 
 
 
428 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  46.74 
 
 
356 aa  53.5  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2840  hypothetical protein  28.96 
 
 
352 aa  52.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.884921  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  35.25 
 
 
504 aa  52  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  36.47 
 
 
489 aa  50.8  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4258  hypothetical protein  27.8 
 
 
518 aa  50.4  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.24252  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  29.71 
 
 
840 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47823  predicted protein  46.55 
 
 
219 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  48.74 
 
 
605 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  36.84 
 
 
555 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  54.24 
 
 
1281 aa  48.1  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3859  hypothetical protein  49.22 
 
 
182 aa  48.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  40.22 
 
 
942 aa  47.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4658  mucin 2  63.64 
 
 
794 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0296531  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0681  hypothetical protein  44.05 
 
 
309 aa  47.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.735733 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  50 
 
 
449 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  38.28 
 
 
693 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  32.89 
 
 
551 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  45.24 
 
 
329 aa  45.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  71.15 
 
 
497 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  39.26 
 
 
904 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.28 
 
 
261 aa  45.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>