94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1160 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  100 
 
 		 269 aa  513  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  58.73 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  52.15 
 
 		 164 aa  126  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  54.81 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  44.08 
 
 		 219 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  50 
 
 		 161 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  50 
 
 		 161 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  54.2 
 
 		 175 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  48.57 
 
 		 174 aa  112  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  54.2 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  47.62 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  47.68 
 
 		 162 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  48.57 
 
 		 161 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  48.57 
 
 		 162 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  46.85 
 
 		 238 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  45.12 
 
 		 174 aa  102  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  41.04 
 
 		 223 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  46.98 
 
 		 169 aa  99.8  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  42.22 
 
 		 191 aa  98.2  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  45.65 
 
 		 193 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  43.8 
 
 		 173 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  53.33 
 
 		 362 aa  92.4  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  46.49 
 
 		 331 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  51.13 
 
 		 170 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  44.88 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  40 
 
 		 193 aa  87  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  45.93 
 
 		 177 aa  85.9  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  44.44 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  44.62 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  36.51 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.26 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  36.44 
 
 		 205 aa  68.6  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  36.59 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  34.78 
 
 		 468 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  33.61 
 
 		 321 aa  53.5  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  25.74 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  33.07 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  30.61 
 
 		 358 aa  50.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  37.86 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  30.28 
 
 		 2449 aa  50.4  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  28.87 
 
 		 269 aa  49.7  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  30 
 
 		 308 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  38.61 
 
 		 276 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  28.26 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  22.34 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  37.62 
 
 		 440 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  30.82 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  36.63 
 
 		 439 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  29 
 
 		 323 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0085  Peptidase M23  24.06 
 
 		 357 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.869131 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  28.1 
 
 		 260 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  32.32 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 349 aa  46.2  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  31.31 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  31.54 
 
 		 411 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  34.41 
 
 		 916 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  30.23 
 
 		 446 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  35.29 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2032  ribonuclease  27.87 
 
 		 1142 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.390229  normal  0.144876 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  24.2 
 
 		 824 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3111  peptidase M23B  30.72 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.324565  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  31.03 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  29.37 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  30.4 
 
 		 375 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  23.77 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  29.19 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  30.43 
 
 		 395 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  29.34 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  29.41 
 
 		 223 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  32.35 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  35.29 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  35.29 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  35.29 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  35.29 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06164  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08440)  32.11 
 
 		 2510 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0773331  normal  0.0726858 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  30.16 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1065  peptidase M23B  30.33 
 
 		 373 aa  43.5  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0161444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3741  peptidase M23B  34.59 
 
 		 332 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  35.29 
 
 		 299 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  25.98 
 
 		 478 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  35.29 
 
 		 299 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  35.29 
 
 		 299 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  35.29 
 
 		 299 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  37.62 
 
 		 293 aa  43.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  30.65 
 
 		 491 aa  43.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  25 
 
 		 320 aa  43.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  29.63 
 
 		 328 aa  43.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4026  peptidase M23B  29.63 
 
 		 539 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  28.74 
 
 		 262 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  30.71 
 
 		 404 aa  42.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  29.89 
 
 		 237 aa  42.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  34.62 
 
 		 404 aa  42.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  32.35 
 
 		 299 aa  42  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>