More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3114 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  100 
 
 		 170 aa  317  5e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  56.96 
 
 		 164 aa  140  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  59.56 
 
 		 214 aa  137  8.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  52.2 
 
 		 219 aa  135  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  47.9 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  61.79 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  53.85 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  47.31 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  50.34 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  50.34 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  50.34 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  51.13 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  51.88 
 
 		 249 aa  115  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  51.01 
 
 		 169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  50 
 
 		 254 aa  108  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  46.77 
 
 		 331 aa  107  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  48.68 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  51.13 
 
 		 269 aa  103  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  53.03 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  49.28 
 
 		 238 aa  102  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  49.59 
 
 		 291 aa  102  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  37.5 
 
 		 170 aa  101  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  51.59 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  56.72 
 
 		 362 aa  99  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  44.44 
 
 		 193 aa  98.6  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  41.4 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  49.18 
 
 		 193 aa  95.1  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  52.38 
 
 		 177 aa  93.6  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  46.21 
 
 		 139 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  39.17 
 
 		 195 aa  92  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.54 
 
 		 271 aa  92  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  46.15 
 
 		 203 aa  89  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  34.92 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  31.29 
 
 		 491 aa  63.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  40.15 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  34.38 
 
 		 373 aa  58.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  32.89 
 
 		 469 aa  58.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1379  Peptidase M23  30.88 
 
 		 420 aa  57.8  0.00000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  38.24 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2623  Peptidase M23  34.32 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  43.48 
 
 		 415 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  39.29 
 
 		 445 aa  55.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  36.76 
 
 		 392 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  36.45 
 
 		 490 aa  55.1  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  33.09 
 
 		 402 aa  55.1  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  31.82 
 
 		 282 aa  54.7  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  36.89 
 
 		 286 aa  54.7  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  38.81 
 
 		 266 aa  54.7  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  36.94 
 
 		 446 aa  53.9  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  36.79 
 
 		 468 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  32.56 
 
 		 402 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  34.01 
 
 		 293 aa  53.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  36.79 
 
 		 468 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  34 
 
 		 446 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  36.79 
 
 		 468 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  36.79 
 
 		 468 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2224  peptidase M23B  35.96 
 
 		 456 aa  52.8  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000268272  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  36.89 
 
 		 465 aa  52.4  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  35.85 
 
 		 288 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  35.85 
 
 		 468 aa  52.4  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19390  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.34 
 
 		 287 aa  52  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  27.43 
 
 		 262 aa  52  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  35.24 
 
 		 470 aa  52  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  37.11 
 
 		 299 aa  52  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  37.23 
 
 		 321 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0512  peptidase M23B  39.39 
 
 		 453 aa  51.6  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0024686  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  37.23 
 
 		 318 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  37.98 
 
 		 319 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1189  Peptidase M23  36.45 
 
 		 441 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000449419  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  34.62 
 
 		 471 aa  51.6  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  34.62 
 
 		 471 aa  51.2  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  39.25 
 
 		 294 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  39.25 
 
 		 291 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  33.65 
 
 		 450 aa  51.2  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  37.23 
 
 		 464 aa  51.2  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  28.57 
 
 		 447 aa  50.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  39.25 
 
 		 292 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  28.57 
 
 		 447 aa  50.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  31.15 
 
 		 386 aa  50.8  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  31.01 
 
 		 475 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 386 aa  50.4  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  34.65 
 
 		 299 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  30.19 
 
 		 285 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4626  peptidase M23B  41.3 
 
 		 592 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  39.53 
 
 		 472 aa  50.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  32.03 
 
 		 455 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  37.72 
 
 		 402 aa  50.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  31.01 
 
 		 473 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  34.65 
 
 		 299 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  39.53 
 
 		 491 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  35.05 
 
 		 379 aa  50.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  40.7 
 
 		 466 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  34.65 
 
 		 299 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  36.19 
 
 		 462 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 386 aa  50.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  32.03 
 
 		 375 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0038  peptidase M23B  41.3 
 
 		 597 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  34.78 
 
 		 491 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  38.37 
 
 		 466 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  34.65 
 
 		 299 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>