More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0988 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  100 
 
 		 174 aa  335  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  62.5 
 
 		 223 aa  152  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  57.97 
 
 		 214 aa  141  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  53.16 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  50.61 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  54.11 
 
 		 219 aa  124  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  56.3 
 
 		 362 aa  117  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  51.45 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  51.45 
 
 		 161 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  51.45 
 
 		 161 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  50.72 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  48.2 
 
 		 193 aa  111  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  51.59 
 
 		 254 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  51.88 
 
 		 211 aa  107  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  47.77 
 
 		 169 aa  107  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  50.38 
 
 		 139 aa  107  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  43.06 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  49.32 
 
 		 174 aa  103  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  45.12 
 
 		 269 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  43.88 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  44.12 
 
 		 238 aa  99.8  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  47.32 
 
 		 331 aa  99.8  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  49.25 
 
 		 175 aa  98.6  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  47.06 
 
 		 249 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  46.32 
 
 		 203 aa  95.5  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  45.67 
 
 		 291 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  37.5 
 
 		 195 aa  90.9  7e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.24 
 
 		 271 aa  90.5  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  42.34 
 
 		 193 aa  87.4  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  51.52 
 
 		 170 aa  85.5  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  37.6 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  36.36 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  45.9 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  32.03 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  28.67 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  42.06 
 
 		 498 aa  58.5  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  29.87 
 
 		 377 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  29.87 
 
 		 377 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  42.2 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  29.87 
 
 		 377 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  29.87 
 
 		 377 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  32.81 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  29.87 
 
 		 377 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  30.5 
 
 		 328 aa  57.8  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0840  Peptidase M23  31.54 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250204  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  36.22 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3506  lipoprotein NlpD  31.11 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  36.22 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  36.22 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  36.22 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3349  lipoprotein NlpD  31.11 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0164165  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  35.43 
 
 		 431 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  35.43 
 
 		 431 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  31.82 
 
 		 395 aa  55.1  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  31.58 
 
 		 428 aa  55.1  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  34.65 
 
 		 431 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  27.74 
 
 		 312 aa  54.7  0.0000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  31.01 
 
 		 401 aa  54.7  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  35.71 
 
 		 475 aa  54.7  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  33.86 
 
 		 434 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  37.14 
 
 		 272 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  38.1 
 
 		 279 aa  53.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  34.48 
 
 		 475 aa  53.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  37.25 
 
 		 429 aa  52.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  30.08 
 
 		 327 aa  53.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  30.08 
 
 		 327 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0732  peptidase M23B  33.33 
 
 		 406 aa  53.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  30.08 
 
 		 327 aa  53.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  33.1 
 
 		 450 aa  53.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  33.33 
 
 		 249 aa  52.4  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  33.57 
 
 		 280 aa  52.4  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  37.14 
 
 		 285 aa  52.8  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  36.36 
 
 		 466 aa  52.4  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  38.05 
 
 		 282 aa  52.4  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  40.78 
 
 		 311 aa  52.4  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  30.23 
 
 		 379 aa  52  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  30.23 
 
 		 379 aa  52  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  30.23 
 
 		 379 aa  52  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2837  Peptidase M23  27.45 
 
 		 285 aa  52  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3993  lipoprotein NlpD  30.23 
 
 		 363 aa  52  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  30.23 
 
 		 379 aa  52  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  30.23 
 
 		 379 aa  52  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  30.23 
 
 		 379 aa  52  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  35.59 
 
 		 313 aa  52  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  29.1 
 
 		 311 aa  52  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  31.97 
 
 		 550 aa  52  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  30.23 
 
 		 379 aa  52  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  33.62 
 
 		 491 aa  52  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  30.23 
 
 		 363 aa  52  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  34.65 
 
 		 431 aa  52  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  34.62 
 
 		 439 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  34.85 
 
 		 293 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  31.91 
 
 		 423 aa  50.8  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  36.56 
 
 		 247 aa  50.8  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  27.69 
 
 		 307 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  31.67 
 
 		 286 aa  50.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  36.84 
 
 		 454 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  33.96 
 
 		 330 aa  50.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  35.51 
 
 		 236 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  33.86 
 
 		 419 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>