88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12905 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  488  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  74.47 
 
 		 162 aa  208  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  69.87 
 
 		 161 aa  208  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  69.23 
 
 		 161 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  69.23 
 
 		 161 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  66.04 
 
 		 162 aa  203  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  49.7 
 
 		 174 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  54.29 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  55.71 
 
 		 164 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  48.08 
 
 		 169 aa  131  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  55.47 
 
 		 175 aa  131  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  52.17 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  47.62 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  50.37 
 
 		 211 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  50.44 
 
 		 331 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  51.88 
 
 		 170 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  46.27 
 
 		 139 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  45.19 
 
 		 291 aa  101  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  43.26 
 
 		 173 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  46.48 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  46.72 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  47.06 
 
 		 174 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  38.85 
 
 		 195 aa  95.9  6e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  48.89 
 
 		 177 aa  92.8  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  45.65 
 
 		 362 aa  92  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  49.56 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  38.66 
 
 		 170 aa  88.6  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  43.85 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.54 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.88 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  41.79 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  37.06 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  30.87 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  33.04 
 
 		 491 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  43.02 
 
 		 490 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  31.82 
 
 		 491 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  40 
 
 		 387 aa  48.9  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  36.19 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  38.37 
 
 		 471 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  38.37 
 
 		 471 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  38.82 
 
 		 468 aa  47  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  38.37 
 
 		 472 aa  47  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  33.71 
 
 		 447 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  33.71 
 
 		 447 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  36.05 
 
 		 446 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  32.33 
 
 		 437 aa  45.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  24.78 
 
 		 312 aa  44.7  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  32.08 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  34.09 
 
 		 390 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  22.56 
 
 		 282 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  34.12 
 
 		 300 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  38.05 
 
 		 328 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  32.14 
 
 		 473 aa  43.9  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  31 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  32.71 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  33.63 
 
 		 360 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  27.83 
 
 		 316 aa  43.5  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  36.75 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  32.32 
 
 		 466 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  33.63 
 
 		 360 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  33.63 
 
 		 360 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  32.14 
 
 		 473 aa  43.9  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  32.38 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  31 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  31 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  31 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  36.75 
 
 		 292 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  37.5 
 
 		 296 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  27.21 
 
 		 385 aa  43.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2441  Peptidase M23  33.33 
 
 		 735 aa  43.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00201295  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  30 
 
 		 299 aa  43.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  35.85 
 
 		 404 aa  42.7  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  33.33 
 
 		 402 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  39.53 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  29.25 
 
 		 386 aa  42.7  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  32.95 
 
 		 386 aa  42.7  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  32.95 
 
 		 386 aa  42.7  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  32.56 
 
 		 300 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4026  peptidase M23B  33 
 
 		 539 aa  42  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  37.21 
 
 		 464 aa  42.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  31.43 
 
 		 273 aa  42.4  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4531  Peptidase M23  33.33 
 
 		 137 aa  42  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45926 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  32.38 
 
 		 244 aa  42  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  31.48 
 
 		 462 aa  42  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  44.68 
 
 		 453 aa  42  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  35.24 
 
 		 332 aa  42  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  36.75 
 
 		 291 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0305  peptidase M23  34.91 
 
 		 294 aa  42  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0127827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>