47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10110 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  100 
 
 
238 aa  457  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  53.24 
 
 
164 aa  125  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  39.11 
 
 
173 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  46.3 
 
 
193 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  50.36 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.83 
 
 
219 aa  111  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  49.61 
 
 
191 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  46.85 
 
 
269 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  50.79 
 
 
203 aa  106  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  45.11 
 
 
195 aa  105  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  47.47 
 
 
174 aa  105  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  45.59 
 
 
291 aa  102  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  45.77 
 
 
193 aa  100  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  44.12 
 
 
174 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  51.61 
 
 
175 aa  99  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  52.11 
 
 
177 aa  95.9  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  43.54 
 
 
211 aa  92.8  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  46.67 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  41.03 
 
 
162 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  40.91 
 
 
161 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  40.91 
 
 
161 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  40.91 
 
 
161 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  39.38 
 
 
249 aa  87  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  42.54 
 
 
162 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  46.38 
 
 
170 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  42.54 
 
 
139 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  35.04 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  38.01 
 
 
169 aa  82  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  43.8 
 
 
254 aa  82  0.000000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.16 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  39.85 
 
 
331 aa  75.5  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  32.89 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  42.57 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  32.35 
 
 
417 aa  45.8  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  30.77 
 
 
446 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  35.29 
 
 
537 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  35.29 
 
 
501 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1065  peptidase M23B  30.84 
 
 
373 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0161444  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  33.81 
 
 
412 aa  43.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  35.29 
 
 
299 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  34.34 
 
 
323 aa  43.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  31.82 
 
 
447 aa  42.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0906  Peptidase M23  27.34 
 
 
255 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  31.53 
 
 
339 aa  42  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0307  Peptidase M23  48 
 
 
298 aa  42  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000988851  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1793  peptidase M23B  30 
 
 
426 aa  42  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.532041  normal  0.0360441 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2623  Peptidase M23  33.53 
 
 
311 aa  42  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>