More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2508 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  100 
 
 
191 aa  365  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  60.87 
 
 
164 aa  141  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  57.04 
 
 
214 aa  135  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  53.9 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  50.61 
 
 
174 aa  132  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  62.1 
 
 
175 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  54.42 
 
 
174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  49.62 
 
 
173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  43.6 
 
 
223 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  46.72 
 
 
195 aa  121  8e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  50.72 
 
 
291 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  47.58 
 
 
193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  50 
 
 
162 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  51.82 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  51.82 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  51.82 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  48.72 
 
 
331 aa  108  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  53.85 
 
 
170 aa  108  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  49.61 
 
 
238 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  48.61 
 
 
169 aa  105  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  46.72 
 
 
162 aa  105  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  47.86 
 
 
193 aa  105  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  40.16 
 
 
205 aa  101  5e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  52.63 
 
 
211 aa  101  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  48.55 
 
 
269 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  46.48 
 
 
249 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.98 
 
 
271 aa  99  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  45.19 
 
 
139 aa  99  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  48.18 
 
 
203 aa  97.8  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  49.22 
 
 
254 aa  95.5  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  50.72 
 
 
362 aa  92  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  38.21 
 
 
170 aa  91.7  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  51.64 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  30.97 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  41.44 
 
 
464 aa  65.1  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  38.46 
 
 
313 aa  61.6  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  48.04 
 
 
425 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0038  peptidase M23B  43.64 
 
 
597 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  42.86 
 
 
232 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4626  peptidase M23B  43.64 
 
 
592 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  38.94 
 
 
470 aa  59.7  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  37.82 
 
 
464 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  35.65 
 
 
293 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  35.09 
 
 
402 aa  59.7  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  36.36 
 
 
445 aa  59.3  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  36.8 
 
 
253 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  34.83 
 
 
274 aa  59.3  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  36.28 
 
 
446 aa  58.9  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  43.43 
 
 
334 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  47.06 
 
 
425 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 
388 aa  58.5  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  37.25 
 
 
247 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  39.58 
 
 
498 aa  58.2  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  42 
 
 
332 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  39.42 
 
 
490 aa  57.8  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  36.11 
 
 
285 aa  57.8  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  36.63 
 
 
358 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  36.51 
 
 
379 aa  57.4  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  41 
 
 
321 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  40.21 
 
 
447 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  35.59 
 
 
457 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  37.27 
 
 
302 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  44.95 
 
 
421 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  34.06 
 
 
375 aa  56.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  36.45 
 
 
339 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  44.32 
 
 
293 aa  57  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  44.95 
 
 
400 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  33.33 
 
 
491 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  47.57 
 
 
454 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  39.18 
 
 
448 aa  56.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  44.95 
 
 
421 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  38.37 
 
 
447 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  38.37 
 
 
447 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  36.63 
 
 
321 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  34.23 
 
 
266 aa  55.5  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3111  peptidase M23B  44.44 
 
 
225 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.324565  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  35.58 
 
 
471 aa  55.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  39.58 
 
 
439 aa  55.5  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  34.19 
 
 
465 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  34.34 
 
 
299 aa  55.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  32.73 
 
 
286 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  39.08 
 
 
255 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  43.56 
 
 
610 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  42.86 
 
 
420 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  33.33 
 
 
299 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  44.04 
 
 
412 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  33.88 
 
 
244 aa  55.1  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.82 
 
 
304 aa  55.1  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  40.48 
 
 
276 aa  55.1  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  35.42 
 
 
280 aa  54.7  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  38.38 
 
 
527 aa  55.1  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  36.94 
 
 
305 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  35 
 
 
349 aa  55.1  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  36.94 
 
 
305 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  44.05 
 
 
324 aa  55.1  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  36.45 
 
 
340 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  32.58 
 
 
223 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  26.9 
 
 
271 aa  54.7  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  38 
 
 
348 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  38.38 
 
 
351 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>