More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1314 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  100 
 
 		 164 aa  308  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  81.56 
 
 		 214 aa  221  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  62.6 
 
 		 175 aa  148  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  60.87 
 
 		 191 aa  141  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  56.3 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  53.16 
 
 		 174 aa  138  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  55.63 
 
 		 161 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  54.93 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  50.94 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  54.93 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  55.71 
 
 		 249 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  57.14 
 
 		 291 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  54.86 
 
 		 219 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  51.82 
 
 		 162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  52.15 
 
 		 269 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  50.71 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  53.24 
 
 		 238 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  50.68 
 
 		 169 aa  123  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  60.29 
 
 		 170 aa  123  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  55.78 
 
 		 211 aa  122  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  46 
 
 		 173 aa  121  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  62.5 
 
 		 362 aa  120  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  50.65 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  52.99 
 
 		 139 aa  118  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  57.97 
 
 		 223 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  51.75 
 
 		 193 aa  117  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  54.03 
 
 		 254 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  47.29 
 
 		 331 aa  111  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  45.16 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  43.61 
 
 		 195 aa  106  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  38.51 
 
 		 205 aa  104  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  53.38 
 
 		 177 aa  97.1  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.74 
 
 		 271 aa  88.2  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  38.46 
 
 		 465 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  31.78 
 
 		 469 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  34.92 
 
 		 375 aa  61.2  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4531  Peptidase M23  41.24 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45926 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  33.86 
 
 		 446 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  27.74 
 
 		 312 aa  58.5  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  37.84 
 
 		 457 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  35.09 
 
 		 369 aa  58.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  33.33 
 
 		 402 aa  58.2  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  31.72 
 
 		 286 aa  58.2  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  35.09 
 
 		 319 aa  58.2  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  34.62 
 
 		 453 aa  57.8  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  33.85 
 
 		 484 aa  57.8  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  37.37 
 
 		 321 aa  57.4  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  39.22 
 
 		 313 aa  57  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  39 
 
 		 470 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  33.85 
 
 		 449 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  34.4 
 
 		 541 aa  55.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  31.54 
 
 		 474 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  32.31 
 
 		 478 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.07 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  36.94 
 
 		 453 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  31.54 
 
 		 471 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  34.82 
 
 		 464 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  36.61 
 
 		 464 aa  55.1  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  38.6 
 
 		 425 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0038  peptidase M23B  36.52 
 
 		 597 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  36.22 
 
 		 420 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  33.33 
 
 		 299 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1065  peptidase M23B  33.66 
 
 		 373 aa  54.3  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0161444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  31.54 
 
 		 464 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  36.22 
 
 		 412 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  34 
 
 		 471 aa  53.9  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  37.84 
 
 		 464 aa  53.9  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  31.88 
 
 		 285 aa  53.9  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  30.28 
 
 		 395 aa  53.9  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  35.43 
 
 		 454 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  38.46 
 
 		 284 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  34.31 
 
 		 299 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  42 
 
 		 292 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  42 
 
 		 294 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  35.92 
 
 		 318 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  31.93 
 
 		 305 aa  53.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  36.22 
 
 		 400 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  35.43 
 
 		 454 aa  53.9  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  31.13 
 
 		 282 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  33.33 
 
 		 388 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  42 
 
 		 291 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  32.81 
 
 		 417 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  33.98 
 
 		 480 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  29.01 
 
 		 417 aa  53.1  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  38.14 
 
 		 421 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0255  peptidase M23B  30.52 
 
 		 305 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  37.72 
 
 		 425 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  38.14 
 
 		 421 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  28.36 
 
 		 491 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  28.43 
 
 		 262 aa  52.4  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  32.74 
 
 		 385 aa  52  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  33 
 
 		 471 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4626  peptidase M23B  39.25 
 
 		 592 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  34.65 
 
 		 656 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  34.31 
 
 		 299 aa  52  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  33.09 
 
 		 452 aa  52  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  31.91 
 
 		 379 aa  52  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  32.39 
 
 		 328 aa  52  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  34.31 
 
 		 299 aa  52  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  34.31 
 
 		 299 aa  52  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>