More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2038 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  100 
 
 
161 aa  315  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  100 
 
 
161 aa  315  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  98.76 
 
 
161 aa  311  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  69.14 
 
 
162 aa  223  8e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  74.07 
 
 
162 aa  221  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  69.23 
 
 
249 aa  206  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  51.57 
 
 
174 aa  144  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  56.3 
 
 
214 aa  140  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  55.07 
 
 
219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  54.93 
 
 
164 aa  135  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  48.45 
 
 
169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  55.47 
 
 
175 aa  123  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  43.98 
 
 
173 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  53.1 
 
 
331 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  50 
 
 
269 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  51.45 
 
 
174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  49.24 
 
 
139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  45.86 
 
 
193 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  52.21 
 
 
211 aa  110  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  51.82 
 
 
191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  50 
 
 
291 aa  106  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  51.11 
 
 
362 aa  104  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  51.45 
 
 
177 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  54.39 
 
 
223 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  52.63 
 
 
170 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  50.39 
 
 
254 aa  99.8  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  42.5 
 
 
170 aa  97.4  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  39.01 
 
 
195 aa  95.5  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  45 
 
 
193 aa  92  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  48.84 
 
 
203 aa  90.1  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  43.61 
 
 
238 aa  87  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  34.68 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.86 
 
 
271 aa  80.5  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  39.33 
 
 
491 aa  57.8  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  39.66 
 
 
468 aa  57.4  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  35.71 
 
 
491 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  33.11 
 
 
452 aa  57  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  32.76 
 
 
395 aa  55.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  40 
 
 
253 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  41.23 
 
 
328 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  33.05 
 
 
244 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  32.2 
 
 
266 aa  54.7  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  29.2 
 
 
312 aa  53.9  0.0000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  38.71 
 
 
230 aa  53.9  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  32.2 
 
 
273 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  37.65 
 
 
323 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2079  M24/M37 family peptidase  38.24 
 
 
435 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000207856  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  38.71 
 
 
527 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  39.78 
 
 
411 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  35.42 
 
 
390 aa  52  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  39.83 
 
 
372 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  37.89 
 
 
296 aa  51.6  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  33.78 
 
 
453 aa  51.6  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  36.54 
 
 
376 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  36.79 
 
 
295 aa  50.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  35.04 
 
 
333 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  32.59 
 
 
286 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  29.41 
 
 
282 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  47.67 
 
 
605 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  36.54 
 
 
441 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1311  peptidase M23B  39.56 
 
 
440 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000378808  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0305  peptidase M23  41.18 
 
 
294 aa  49.7  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0127827  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  32.74 
 
 
533 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  40 
 
 
387 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2376  peptidase M23B  37.04 
 
 
186 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  40 
 
 
271 aa  49.7  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  35.11 
 
 
389 aa  49.3  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  35.56 
 
 
353 aa  49.3  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  41.67 
 
 
457 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  44.19 
 
 
303 aa  48.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  38.82 
 
 
248 aa  48.9  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  37.5 
 
 
271 aa  48.9  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0414  Peptidase M23  37.63 
 
 
436 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0487693 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  40.91 
 
 
431 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  35.9 
 
 
484 aa  48.9  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  35.4 
 
 
437 aa  48.5  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  35.82 
 
 
387 aa  48.5  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0866  Peptidase M23  36.08 
 
 
489 aa  48.5  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.329722  normal 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  37.29 
 
 
195 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  35.14 
 
 
285 aa  48.1  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  37.08 
 
 
358 aa  48.1  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  38.82 
 
 
450 aa  48.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.33 
 
 
326 aa  48.1  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  37.61 
 
 
231 aa  48.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  33.04 
 
 
198 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  35.23 
 
 
271 aa  47.8  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  34.82 
 
 
503 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  34.21 
 
 
334 aa  48.1  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  31.25 
 
 
316 aa  47.8  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  33.33 
 
 
402 aa  47.8  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3111  peptidase M23B  32 
 
 
225 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.324565  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  36.84 
 
 
569 aa  48.1  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  33.04 
 
 
198 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1189  Peptidase M23  33.63 
 
 
441 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000449419  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  32.74 
 
 
285 aa  47.8  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  38.89 
 
 
590 aa  47.8  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  37.14 
 
 
276 aa  47.8  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  34.85 
 
 
509 aa  47.8  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  39.81 
 
 
669 aa  47.8  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  39.53 
 
 
464 aa  47.4  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>