290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0675 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  699    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  62.04 
 
 		 214 aa  146  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  62.32 
 
 		 164 aa  139  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  54.07 
 
 		 162 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  58.74 
 
 		 223 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  40.89 
 
 		 291 aa  126  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  57.04 
 
 		 174 aa  126  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  51.85 
 
 		 139 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  50.3 
 
 		 161 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  50.3 
 
 		 161 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  49.7 
 
 		 161 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  47.59 
 
 		 162 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  52.24 
 
 		 211 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  54.47 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  43.09 
 
 		 249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  53.33 
 
 		 269 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  53.33 
 
 		 175 aa  113  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  44.64 
 
 		 174 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  42.76 
 
 		 173 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  48.55 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  51.45 
 
 		 191 aa  106  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  47.79 
 
 		 193 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.86 
 
 		 219 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  43.45 
 
 		 169 aa  99.8  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  55.22 
 
 		 177 aa  97.1  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.76 
 
 		 271 aa  95.9  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  57.46 
 
 		 170 aa  94  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  38.46 
 
 		 170 aa  93.6  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  41.22 
 
 		 195 aa  90.5  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  43.51 
 
 		 203 aa  89.4  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  38.93 
 
 		 205 aa  88.6  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  43.24 
 
 		 238 aa  88.2  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  44.95 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  35.9 
 
 		 498 aa  57  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  30.15 
 
 		 386 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  30.15 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  30.15 
 
 		 386 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  28.75 
 
 		 283 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  35 
 
 		 375 aa  54.3  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  37.04 
 
 		 475 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  35.64 
 
 		 517 aa  53.5  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  31.01 
 
 		 469 aa  53.1  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  26.44 
 
 		 390 aa  53.1  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  33.04 
 
 		 385 aa  53.1  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  33.33 
 
 		 480 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  27.01 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  34.26 
 
 		 472 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  32.56 
 
 		 460 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  36.69 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1389  M24/M37 family peptidase  28.75 
 
 		 204 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000798303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1500  M23/37 family peptidase  28.75 
 
 		 204 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000118576  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  31.58 
 
 		 446 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  31.37 
 
 		 282 aa  50.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  34.26 
 
 		 473 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  29.27 
 
 		 482 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  33.11 
 
 		 466 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  32.26 
 
 		 236 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  32.26 
 
 		 233 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  34.26 
 
 		 475 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  32.26 
 
 		 233 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  33.83 
 
 		 304 aa  50.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  32.26 
 
 		 296 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  32.26 
 
 		 296 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  35 
 
 		 490 aa  50.4  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  34.26 
 
 		 473 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  33.86 
 
 		 464 aa  50.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  34.23 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  36 
 
 		 452 aa  50.8  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  32.26 
 
 		 233 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  32.26 
 
 		 233 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  33.33 
 
 		 262 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  33.33 
 
 		 262 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  35.96 
 
 		 402 aa  50.4  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  33.33 
 
 		 285 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  35.97 
 
 		 232 aa  50.4  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3617  peptidase M23B  39.34 
 
 		 457 aa  50.1  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0923859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3955  peptidase M23B  39.34 
 
 		 457 aa  50.1  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053083  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  35.78 
 
 		 456 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  32.17 
 
 		 288 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1793  peptidase M23B  31.71 
 
 		 426 aa  49.7  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.532041  normal  0.0360441 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  34 
 
 		 471 aa  49.3  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  34 
 
 		 471 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  31.94 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  31.06 
 
 		 491 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  36.45 
 
 		 503 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  34.11 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  29.46 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  35.78 
 
 		 457 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  35.78 
 
 		 459 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1534  peptidase, M23/M37 family  28.75 
 
 		 204 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  34.26 
 
 		 468 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  41.03 
 
 		 415 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  35.78 
 
 		 462 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0798  Peptidase M23  42.35 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  33.33 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  36.27 
 
 		 306 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  36.69 
 
 		 421 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0826  Peptidase M23  42.35 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  41.67 
 
 		 459 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  31.75 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>