87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0396 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  100 
 
 		 195 aa  399  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  51.85 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  46.72 
 
 		 191 aa  119  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.41 
 
 		 219 aa  111  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  43.61 
 
 		 164 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.11 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  41.35 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  42.34 
 
 		 174 aa  101  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  36.53 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  39.01 
 
 		 161 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  39.01 
 
 		 161 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  39.01 
 
 		 161 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  37.82 
 
 		 223 aa  94.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  38.85 
 
 		 249 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  38.69 
 
 		 162 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  38.13 
 
 		 162 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  39.67 
 
 		 173 aa  90.5  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  37.5 
 
 		 174 aa  90.5  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  41.73 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  40.31 
 
 		 175 aa  87.8  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  41.44 
 
 		 170 aa  87.8  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  36.2 
 
 		 193 aa  87.8  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  36.36 
 
 		 169 aa  86.7  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  38.93 
 
 		 211 aa  85.9  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  40.3 
 
 		 177 aa  84.3  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  40.83 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  38.33 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  37.12 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  36.51 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  40.18 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  36.52 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.36 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  39.85 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  32.82 
 
 		 345 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  27.1 
 
 		 299 aa  47.8  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  33.33 
 
 		 457 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  33.33 
 
 		 457 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  32.06 
 
 		 450 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  34.68 
 
 		 454 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  24.3 
 
 		 299 aa  46.2  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  29.17 
 
 		 429 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  28.8 
 
 		 500 aa  45.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  33.33 
 
 		 457 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  26.17 
 
 		 299 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  28.21 
 
 		 459 aa  45.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  28.47 
 
 		 446 aa  45.1  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  28 
 
 		 417 aa  45.1  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  36.17 
 
 		 448 aa  45.1  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  35.16 
 
 		 312 aa  44.7  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  24.3 
 
 		 299 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  24.3 
 
 		 299 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  24.3 
 
 		 299 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  28.42 
 
 		 285 aa  43.9  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  24.3 
 
 		 299 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  30.7 
 
 		 285 aa  43.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  28.47 
 
 		 285 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  29.55 
 
 		 491 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  25.66 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  24.3 
 
 		 299 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  24.3 
 
 		 299 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3741  peptidase M23B  29.46 
 
 		 332 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  27.49 
 
 		 449 aa  43.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  24.3 
 
 		 299 aa  42.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  24.3 
 
 		 299 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  24.3 
 
 		 299 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  34.07 
 
 		 294 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  29.27 
 
 		 385 aa  42.4  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  29.37 
 
 		 402 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  32.85 
 
 		 469 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  34.07 
 
 		 291 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  24.3 
 
 		 299 aa  42.4  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  28.87 
 
 		 445 aa  42.7  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  28.12 
 
 		 376 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  34.07 
 
 		 292 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  30.38 
 
 		 402 aa  42.4  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0307  Peptidase M23  34.65 
 
 		 298 aa  42.4  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000988851  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  32.59 
 
 		 280 aa  42  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  29.03 
 
 		 300 aa  42  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  28.97 
 
 		 452 aa  42  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  29.71 
 
 		 232 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  29.13 
 
 		 369 aa  42  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  27.78 
 
 		 272 aa  42  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  26.98 
 
 		 468 aa  42  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  23.36 
 
 		 299 aa  41.2  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  26.26 
 
 		 323 aa  41.2  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  29.23 
 
 		 411 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  35.19 
 
 		 400 aa  41.2  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>