More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1341 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  100 
 
 		 417 aa  821    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  49.19 
 
 		 500 aa  386  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  59.76 
 
 		 447 aa  201  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  71.97 
 
 		 471 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  68.94 
 
 		 478 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  68.46 
 
 		 464 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  70 
 
 		 449 aa  193  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  72.88 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  53.73 
 
 		 537 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  73.73 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  69.29 
 
 		 474 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  73.73 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  68.5 
 
 		 494 aa  189  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  71.79 
 
 		 501 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  33.43 
 
 		 509 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  66.15 
 
 		 453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  33.62 
 
 		 538 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  33.06 
 
 		 530 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  32.52 
 
 		 534 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  59.84 
 
 		 465 aa  159  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  49.66 
 
 		 412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  57.85 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  57.85 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  57.02 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  55.17 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  52.46 
 
 		 323 aa  137  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  40.56 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  42.24 
 
 		 394 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  48.33 
 
 		 230 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  39.22 
 
 		 264 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  47.5 
 
 		 230 aa  120  6e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  50 
 
 		 261 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  47.9 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  47.9 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  47.9 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  47.9 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  47.9 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  47.9 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  47.9 
 
 		 292 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  37.21 
 
 		 250 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  49.19 
 
 		 290 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  47.15 
 
 		 292 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  45.76 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  45.76 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  45.76 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  45.76 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0061  lipoprotein NlpD  41.92 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  47.41 
 
 		 633 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  40.96 
 
 		 360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1451  lipoprotein NlpD, putative  47.41 
 
 		 384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  44.88 
 
 		 315 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  44.88 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  46.55 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  45.76 
 
 		 251 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  45.76 
 
 		 251 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  45.76 
 
 		 251 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  46.55 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  46.55 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  46.55 
 
 		 292 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  46.15 
 
 		 270 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  46.55 
 
 		 294 aa  114  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  44.92 
 
 		 251 aa  113  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  44.72 
 
 		 312 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  40.74 
 
 		 250 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  40.74 
 
 		 250 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  40.74 
 
 		 250 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  40.74 
 
 		 250 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  45.69 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  44.92 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  44.92 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  40.12 
 
 		 250 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  44.92 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  44.92 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  44.92 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  44.92 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  44.07 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  42.66 
 
 		 246 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  45.69 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  44.92 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  44.92 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  44.92 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  44.92 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  34.78 
 
 		 377 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  44.92 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  46.09 
 
 		 322 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3993  lipoprotein NlpD  44.92 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  44.92 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0840  Peptidase M23  46.61 
 
 		 404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250204  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  40.91 
 
 		 285 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  46.15 
 
 		 292 aa  110  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  35.11 
 
 		 307 aa  110  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  43.37 
 
 		 262 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  43.97 
 
 		 318 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  40 
 
 		 284 aa  109  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  43.75 
 
 		 274 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  48.28 
 
 		 293 aa  109  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  42.77 
 
 		 262 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  34.43 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  45.61 
 
 		 295 aa  109  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  44.83 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>